France

Automatiser des analyses génomiques grâce aux commandes Linux et à l'écriture de scripts

Type: 
Formation
Date: 
19/02/2018 - 23/02/2018
Ville: 
Montpeller
Pays: 
France
Courte description: 
Les objectifs pédagogiques de cette formation sont : - connaître les commandes essentielles du système Linux, - savoir les utiliser pour traiter des données génomiques, - être capable d’utiliser un cluster de calculs pour effectuer ces traitements. - savoir écrire des scripts « simples » en « bash » (le langage de base de Linux)

PREMIERS PAS EN BIO-INFORMATIQUE, UNE APPROCHE PAR LA PRATIQUE

Type: 
Formation
Date: 
12/02/2018 - 16/02/2018
Ville: 
Montpellier
Pays: 
France
Courte description: 
Les principaux objectifs de ce module sont : - Etre capable d’exploiter plus efficacement les ressources génomiques disponibles sur Internet (requêtes avancées et automatisation de téléchargements de données, notamment via NCBI et EnsEMBL) - Etre capable d’analyser un tableau de données à l’aide de fonctions avancées d’Excel (formules, tableau croisé dynamique) - Savoir se connecter à un serveur de calcul distant et y transférer des fichiers - Connaître les commandes de base du système Linux et savoir les utiliser sur un serveur de calculs - Avoir une connaissance des concepts utilisés par les outils de nettoyage, assemblage et mapping de reads NGS - Etre capable de faire un blast en local et d’en filtrer automatiquement les résultats - Bien comprendre les notions de variables, de tests et de boucles qui seront détaillées, fournissant ainsi une première base pour découvrir ensuite les langages de programmation.

Single Cell OMICS Data Analysis Workshop

Type: 
Colloque
Date: 
01/12/2017
Ville: 
Sophia Antipolis
Pays: 
France
Courte description: 
This 1-day workshop aims at fostering discussion among biostatistics/bioinformatics groups specialized single cell OMICS data analysis, around an overview of recent developments.

alphy-GTGC 2018

Type: 
Colloque
Date: 
07/02/2018 - 08/02/2018
Ville: 
Montpellier
Pays: 
France
Courte description: 
Les colloques AlPhy et GTGC (Groupe de Travail en Génomique Comparative) seront organisées conjointement en 2018. Il s'agit de rencontres autour de la génomique évolutive au sens large, ainsi que les méthodes associées, visant notamment à faire participer les jeunes chercheurs et étudiants de notre communauté. Les deux orateurs invités seront cette année Sophie Abby (Grenoble) et Eric Tannier (Lyon).

JOBIM 2018

Type: 
Colloque
Date: 
03/07/2018 - 06/07/2018
Ville: 
Marseilles
Pays: 
France
Courte description: 
JOBIM est le rendez-vous de la communauté scientifique bioinformatique, chercheurs bioinformaticiens, biologistes, mathématiciens, informaticiens et physiciens, doctorants, étudiants, ingénieurs, organismes de recherche, acteurs économiques.
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