France

Single Cell OMICS Data Analysis Workshop

Type: 
Colloque
Date: 
18/01/2019
Ville: 
Sophia Antipolis
Pays: 
France
Courte description: 
The 2nd Single Cell OMICS Data Analysis Workshop will take place in Sophia Antipolis, France, on January 18th, 2019. This workshop aims at fostering discussion among biostatistics/bioinformatics groups specialized single cell OMICS data analysis, around an overview of recent developments.

Workshop "Single-cell transcriptomics and epigenomics (sincellTE)"

Type: 
Formation
Date: 
03/02/2019 - 08/02/2019
Ville: 
Roscoff
Pays: 
France
Courte description: 
This one-week class focuses on the large-scale study of heterogeneity across individual cells from the genomic, transcriptomic and epigenomic points of view.

ALPHY

Acronyme: 
ALPHY
Type: 
Colloque
Date: 
07/02/2019 - 08/02/2019
Ville: 
Paris
Pays: 
France
Courte description: 
Il s'agit d'une réunion annuelle financée par le GDR BIM autour des mots clé "phylogénie", "génomique évolutive" et "bioinformatique". Les étudiants et jeunes chercheurs sont notamment encouragés à soumettre un résumé. Ils trouveront en ALPHY un contexte peu formel et propice à la discussion, tout en permettant un tour d'horizon des développements récents et des axes émergents sur ces thématiques en France.

journées NETBIO

Acronyme: 
NETBIO
Type: 
Colloque
Date: 
13/12/2018 - 14/12/2018
Ville: 
campus Supagro de Montpellier
Pays: 
France
Courte description: 
La compréhension de systèmes biologiques faisant intervenir de nombreux acteurs potentiels (e.g. protéines, métabolites, etc.) passe par l'identification d'interactions entre ces acteurs que l'on représente sous forme de réseaux. Les statisticiens et informaticiens ont développé ces dernières années toute une gamme de méthodologies pour inférer ces réseaux, souvent à partir de connaissances ou données très réduites. Des logiciels sont aujourd'hui accessibles et diffusés soit sous forme de paquetages libres (GGMSelect, SIMoNe, ParCorA, Banjo, etc.), soit sous forme commerciale (Ingenuity, Genevestigator, Pathway Tool, etc.). En collaboration avec des biologistes, plusieurs chercheurs du département sont engagés au sein de projets de biologie des systèmes en microbiologie, en biologie végétale, en biologie animale. Toutefois la complexité du vivant fait que souvent les méthodes proposées ne sont pas pertinentes pour des organismes ayant des dizaines de milliers de gènes. C'est pourquoi la vocation de NETBIO est de créer un espace pour échanger sur les méthodes statistiques et bioinformatiques pour la construction et l'analyse de graphes et de discuter de l'adéquation de la modélisation par rapport aux problématiques biologiques.

Workshop Anniversary 20th RSAT/ 15th GINsim

Type: 
Colloque
Date: 
16/05/2018 - 17/05/2018
Ville: 
75 - Paris
Pays: 
France
Courte description: 
Indeed, 2018 marks the 20th anniversary of the first publication on RSAT (http://rsat.eu/), as well as the 15th anniversary of the first publication on GINsim (http://ginsim.org/). We propose to celebrate this joint event at IBENS in Paris, on May 16-17, 2018, with a series of invited talks on the computational modelling and analysis of ci-regulatory regions and cellular networks, and practical tutorials on RSAT and GINsim for biologists.

Computational biology softwares tend to be a relatively short life.
RSAT (http://rsat.eu/) and GINsim (http://ginsim.org/) are notable exceptions, in large part thanks to active and friendly networks of collaborators.
Indeed, 2018 marks the 20th anniversary of the first publication on RSAT, as well as the 15th anniversary of the first publication on GINsim.

We propose to celebrate this joint event at IBENS in Paris, on May 16-17, 2018.

The first day will be devoted to a series invited talks on the computational modelling and analysis of ci-regulatory regions and cellular networks.
The second day will be devoted to tutorials on RSAT and GINsim for biologists.

Invited speakers:

• Samuel Collombet, Institut Curie, Paris
• Claudine Chaouiya, IGC, Lisbon, Portugal
• Bruno Contreiras Moreira, Estación Experimental de Aula Dei-CSIC, Zaragoza, Spain
• Carl Herrmann, Universität Heidelberg, DKFZ, Heidelberg, Germany
• Anthony Mathelier, NCMM, Oslo Norway
• Pedro Monteiro, INESC-ID / IST - Universidade de Lisboa, Portugal
• Elisabeth Remy, Institut de Mathématiques de Marseille
• Hugues Roest Crollius, IBENS, Paris
• Jacques van Helden, TAGC Marseille

Program and registration (free but compulsory) : https://www.ibens.ens.fr/spip.php?article350

Looking forward to meeting you at this event !

Morgane Thomas-Chollier and Denis Thieffry

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