Montpellier

Atelier formation CNRS: "entreprise traitement données ChIP-seq, RNA-seq, Hi-C"

Type: 
Formation
Date: 
26/06/2018 - 29/06/2018
Ville: 
Montpellier
Pays: 
France
Courte description: 
Les principaux objectifs de cet atelier sont les suivants: - Savoir planifier une expérience simple de type ChIP-seq ou RNA-seq - Savoir évaluer la qualité des données obtenues dans le cadre de la régulation des gènes (ChIP-seq) et de l'analyse du transcriptome (RNA-seq) - Maîtriser les principales méthodes et outils d'analyse des données ChIP-seq et RNA-seq - Savoir les visualiser dans un navigateur de génome et en extraire les coordonnées des pics enrichis - Savoir manipuler et annoter les fichiers d'enrichissement (bedtools, DAVID) - Maîtriser les principales méthodes d'analyse des données Hi-C et de génération des cartes de contact chromosomique

Montpellier Omics Days

Acronyme: 
MOD
Type: 
Colloque
Date: 
08/02/2018 - 09/02/2018
Ville: 
Montpellier
Pays: 
France
Courte description: 
Organisées par les étudiants de M2 du parcours « Bioinformatique, Connaissances, Données » (BCD) du Master Sciences et Numérique pour la Santé et les étudiants de M1 du Master Statistique pour les Sciences de la Vie de la Faculté des Sciences de l’Université de Montpellier, les MODS sont des manifestations scientifiques gratuites et ouvertes à tout public intéressé par les dernières avancées dans le domaine du Omique ainsi que les challenges qui découlent. Pour cette 6ème édition, alors que la première journée sera dédiée aux formations (découverte de UNIX, lignes de commandes, analyse de données NGS, analyse statistique avec R), la deuxième journée sera une journée conférence avec des présentations sur les dernières technologies pour l'assemblage des génomes et applications en Santé et Environnemental. Cette année, vous pourrez après inscription soumettre vos résumés afin de présenter vos travaux sous forme d'une présentation orale ou d'un poster.

PREMIERS PAS EN BIO-INFORMATIQUE, UNE APPROCHE PAR LA PRATIQUE

Type: 
Formation
Date: 
12/02/2018 - 16/02/2018
Ville: 
Montpellier
Pays: 
France
Courte description: 
Les principaux objectifs de ce module sont : - Etre capable d’exploiter plus efficacement les ressources génomiques disponibles sur Internet (requêtes avancées et automatisation de téléchargements de données, notamment via NCBI et EnsEMBL) - Etre capable d’analyser un tableau de données à l’aide de fonctions avancées d’Excel (formules, tableau croisé dynamique) - Savoir se connecter à un serveur de calcul distant et y transférer des fichiers - Connaître les commandes de base du système Linux et savoir les utiliser sur un serveur de calculs - Avoir une connaissance des concepts utilisés par les outils de nettoyage, assemblage et mapping de reads NGS - Etre capable de faire un blast en local et d’en filtrer automatiquement les résultats - Bien comprendre les notions de variables, de tests et de boucles qui seront détaillées, fournissant ainsi une première base pour découvrir ensuite les langages de programmation.

alphy-GTGC 2018

Type: 
Colloque
Date: 
07/02/2018 - 08/02/2018
Ville: 
Montpellier
Pays: 
France
Courte description: 
Les colloques AlPhy et GTGC (Groupe de Travail en Génomique Comparative) seront organisées conjointement en 2018. Il s'agit de rencontres autour de la génomique évolutive au sens large, ainsi que les méthodes associées, visant notamment à faire participer les jeunes chercheurs et étudiants de notre communauté. Les deux orateurs invités seront cette année Sophie Abby (Grenoble) et Eric Tannier (Lyon).

Statistical Methods for Post-Genomic Data

Type: 
Colloque
Date: 
11/01/2018 - 12/01/2018
Ville: 
Montpellier
Pays: 
France
Courte description: 
The workshop aims at gathering statisticians, bioinformaticians and biologists to discuss new statistical methodology for the analysis of genomics data and further development of such methodology for challenging new types of genomics data.
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