Bordeaux

Formation CNRS: "Analyse avancée de séquences "

Type: 
Formation
Date: 
29/05/2018 - 30/05/2018
Ville: 
Bordeaux
Pays: 
France
Courte description: 
Le but de cette formation CNRS est de : - Savoir rechercher des informations dans les banques de données - Maîtriser les outils d'analyse de séquences tels que les alignements et savoir interpréter les résultats - Maîtriser les stratégies d'annotation de génomes bactériens - Maîtriser les formats et les analyses des nouvelles données issues du séquençage (NGS) - Prendre en main l'outil Galaxy

Formation CNRS: "Analyses NGS avec R"

Type: 
Formation
Date: 
17/05/2018 - 18/05/2018
Ville: 
Bordeaux
Pays: 
France
Courte description: 
Cette formation introduira les paquetages Bioconductor permettant l'analyse de données issues du séquençage nouvelle génération. - Rappels des concepts du séquençage NGS - Les outils d'annotation et de conversion d'identifiant (bioMart) - L'analyse des reads et du résultat d'alignement - l'analyse d'expression différentielle en RNA-seq - Les techniques d'enrichissement - L'exploitation de données mégatonniques - Les outils de visualisation pour les NGS (GGbio, Circos ?)

Formation CNRS: Language R, Introduction

Type: 
Formation
Date: 
15/05/2018 - 16/05/2018
Ville: 
Bordeaux
Pays: 
France
Courte description: 
Cette formation introduira le langage R et les techniques de fouille et de visualisation de données. - Installation et configuration de R - Notions et commandes essentielles (variables, fonctions ?) - Les formats de fichiers, la lecture et l'écriture de données tabulées - Les outils de manipulation et de transformation de grands tableaux - Les constructions modernes pour la création de graphiques

Fouille de données et analyses NGS avec le langage R

Type: 
Formation
Date: 
20/11/2017 - 23/11/2017
Ville: 
Bordeaux
Pays: 
France
Courte description: 
Cette formation introduira le langage R, les techniques de fouille et de visualisation de données, ainsi que les paquetages Bioconductor permettant l'analyse de données issues du séquençage nouvelle génération. - Le langage R et ses commandes essentielles - Les formats de fichiers, la lecture et l'écriture de données tabulées - Les outils de manipulation et de transformation de grands tableaux - Les outils d'annotation et de conversion d'identifiant biologiques (biomart) - Les outils de visualisation de données - Brève introduction aux techniques NGS - L'alignement de séquences NGS - L'analyse d'expression différentielle (paquetage edgeR) - Les techniques d'enrichissement (DAVID, GO, SPIA)

Analyse avancée de séquences

Type: 
Formation
Date: 
28/11/2016 - 30/11/2016
Ville: 
Bordeaux
Pays: 
France
Courte description: 
Les objectifs de cette formation sont: - Savoir rechercher des informations dans les banques de données - Maitriser les outils d'analyse de séquences tels que les alignements et savoir interpréter les résultats - Maitriser les stratégies d'annotation de génomes bactériens - Maitriser les formats et les analyses des nouvelles données issues du séquençage (NGS)
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