Lyon

CNRS formation: "Préparation des banques NGS à partir d’ARN : les étapes pratiques et méthodologiques"

Type: 
Formation
Date: 
26/03/2018 - 28/03/2018
Ville: 
Lyon
Pays: 
France
Courte description: 
L programme comprend: Une partie théorique (5 h) - Les technologies de séquençage Illumina et Ion Torrent - Les principales méthodes de construction de banques NGS - Format des données générées et généralités sur l'analyse primaire des données - Potentiel des applications de séquençage (illustrations, exemplifications) Une partie pratique (12 h) - Exemple de construction de banques à partir d'ARN : séquençage RNA-seq sur plateforme Ion Torrent - Quantification et qualification des ARNs - Construction d'une banque à partir d'ARN - Contrôle qualité de banques avant séquençage - Amplification emPCR, enrichissement de la banque, séquençage - Récupération des données de séquençage et traitement primaire La dernière demi-journée (3 h) sera consacrée à l'analyse de cas exposés par les stagiaires (questions spécifiques, projets propres de séquençage).

Workshop "Analyse et interprétation des données en protéomique et métabolomique : points communs et spécificités"

Type: 
Colloque
Date: 
28/03/2018
Ville: 
Lyon
Pays: 
France
Courte description: 
La protéomique et la métabolomique sont deux sciences "omiques" complémentaires pour l'étude du vivant et la médecine personnalisée, qui partagent notamment une technique analytique commune : la spectrométrie de masse. Nous sommes heureux de vous accueillir à ce workshop qui est constitué de deux parties visant à présenter un état de l'art sur l'analyse et l'interprétation des données dans chaque discipline, et à faire émerger des axes thématiques transverses.

Formation CNRS: "Calcul de structures 3D de protéines et complexes de protéines à partir de données RMN (liquide ou solide) "

Type: 
Formation
Date: 
26/03/2018 - 28/03/2018
Ville: 
Lyon
Pays: 
France
Courte description: 
Présentation générale des méthodes de calcul de structure de protéines par RMN : attribution de séquences spécifiques des résonances, exploitation des spectres NOE, validation de structures, dépôt dans la base PDB Les différentes étapes de cette formation sont les suivantes: - Description des différents types de contraintes conformationnelles collectables par RMN (déplacements chimiques, NOE, RDCs, PRE, contraintes dérivées de bases de données) et critères de choix de leur utilisation spécifique selon le système étudié - Concepts de modélisation moléculaire pour la détermination structurale de protéines (recuit simulé, dynamique moléculaire) - Présentation et utilisation du logiciel UNIO pour l'analyse automatique des données RMN

Formation CNRS en phylogénie moléculaire

Type: 
Formation
Date: 
20/03/2018 - 23/03/2018
Ville: 
Lyon
Pays: 
France
Courte description: 
Cette formation comprend 50% de cours et 50% de travaux pratiques. Les notions qui seront abordées comprennent : - Alignements de séquences et recherche de similarités. - Modèles d'évolution. - Reconstructions phylogénétiques au moyen des méthodes suivantes : * Maximum de parcimonie. * Distances (minimum d'évolution, neighbor-joining). * Maximum de vraisemblance. * Inférence bayésienne. - Tests (bootstrap, tests de vraisemblance, comparaison de topologies).

European course on "Comparative Genomics"

Type: 
Formation
Date: 
02/10/2017 - 13/10/2017
Ville: 
Lyon
Pays: 
France
Courte description: 
The course is aimed at students from the ENS Lyon and is open to master and PhD students from European universities. The course focuses on major discoveries, big challenges, innovative concepts and original approaches in the field of comparative genomics, their applications in biology and biotechnology, and their impact on society.
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