Bioinformatician for computational epigenetics (CNG/CEA)

Type de poste
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Adresse

<p>Centre National de Génotypage (Commissariat à l&#39;Energie Atomique, Evry)</p>
Evry
France

Contacts
Nizar
Email du/des contacts
touleima@cng.fr
Description

Le Centre National de Génotypage (Commissariat à l'Energie Atomique, Evry)
est impliqué dans de grands projets de recherche nationaux et
internationaux pour étudier les causes de maladies complexes selon
différents aspects biologiques (génétique, transcriptomique,
épigénétique,...) et par des technologies à haut-débit (puces haute
densité, séquençage haut débit). Le flux trés important de données
générées implique alors une automatisation du traitement et l'application
de méthodes d'analyse bioinformatiques complexes et intégratives.
Le CNG, souhaite renforcer son équipe de bioinformaticiens par un poste à
pourvoir immédiatement. Ce poste sera intégré aux laboratoires
d'Epigénétique et de Génomqiue fonctionnelle pour analyser des données
produites par les technologies de séquençage et d'épi-génotypage de
derniére génération, notamment ChIP-seq et Faire-seq.

Ce poste impliquera les activités suivantes :
- Traitement des données : filtrage, normalisation, automatisation du
pré-traitement.
- Analyse de données : recherche de biomarqueurs, analyse de réseaux
biologiques.
- Intégration de données : combinaison de données issues de plusieurs
plateformes, modéles biologiques intégratifs.

Salaire : environ , variable selon l'expérience du candidat.

Formation : Master en Biostatistique, Bioinformatique ou Informatique avec
connaissances de base en génétique/biologie

Qualifications requises :
- Connaissances de base en biologie et en génétique.
- Connaissance des méthodes et logiciels standards de bioinformatique pour
l'analyse de données de type microarray ou NGS.
- Maitrise de l'environnement R et des packages Bioconductor.
- Maitrise de l'environnement Unix/Linux.
- Maitrise d'au moins un langage de script (shell, perl, python) et de
programmation (java, C, ...).
- Connaissances de base en biologie et en génétique.
- De connaissances en statistiques serait un plus.
- Anglais ou Francais courant souhaite.

Envoyer CV et lettre de motivation avec références recrut3@cng.fr
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The National Center for Genotyping (CNG in French) is located in the
French Genopole, in Evry, near Paris. This research center is involved in
major national and international research projects to study complex
diseases according to different biological views (genetic, transcriptomic,
epigenetics, ...) using  high-throughput technologies (high density
microarrays, NGS). The important flow of the biological data produced in
the center implies automated data processing pipelines and the application
of complex and integrative bioinformatics methods.
To strengthen its bioinformatics team, the CNG is immediately recruiting a
qualified bioinformatician. This position will be integrated into the
laboratories of Epigenetics and Functional Genomics to analyze data
produced by second/third generation sequencing and epi-genotyping
technologies, notably ChIP-seq and Faire-seq

The position will require the following activities:
- Project Management
- Data processing: filtering, normalization, pre-processing and
development of automated pipelines.
- Analysis of data: biomarker discovery, analysis of biological networks.
- Data integration: Combining data from multiple platforms, integrative
biological models.

Type of contract: Fixed term contract (~ 30 months)
Salary: according to candidate's experience.

Education: Master required in any of these area : Biostatistics,
Bioinformatics or
Computer Science with some basic knowledge of genetics/biology

Qualifications:
- Knowledge of standard bioinformatics softwares and methods for the
analysis of microarray or NGS data.
- Proficiency in R environment with Bioconductor packages.
- Proficiency in Unix / Linux environment.
- Proficiency in at least one scripting language (shell, perl, python) and
in programming (Java, C, ...).
- Knowledge on statistics is a plus.
- Basic knowledge of biology and genetics.
- Fluent English or French.

Please send your CV and a cover letter with references to recrut3@cng.fr