Acronyme du laboratoire:
GDEC
Tutelles institutionnelles du laboratoire:
INRA (Institut National de la Recherche Agronomique)
Nom de l'équipe:
Structure, Fonction & Evolution des Génomes de Blé
Taille de l'équipe:
10 à 19
SFBI:
Membre de la SFBI
Prénom et nom du responsable de l'équipe:
Catherine Feuillet
E-mail du responsable de l'équipe:
Adresse:
INRA-UBP UMR 1095 - Génétique, Diversité et Ecophysiologie des Céréales
Structure, Fonction & Evolution des Génomes de Blé
234 Avenue du Brèzet
63100 CLERMONT-FERRAND - FRANCE
Ville:
Clermont-Ferrand
Thèmes de recherche (sous la forme de mots-clés):
Cartographie génétique & physique & transcriptomique
clonage positionel
recombinaison génétique
séquençage
annotation structural et fonctionenelle
Pipeline d'annotation TriAnnot
Blé tendre
Triticum aestivum
English keywords:
Genetic & physical & transcriptomic mapping,positional clonage,genetic recombination,genome sequencing,structural and functional annotation,workflow TriAnnot, wheat, Triticum aestivum
Description:
- l'organisation à grande échelle des régions géniques et répétées et la mise en évidence d'îlots riches en gènes ;
- l'étude de la recombinaison le long du chromosome au travers de l'étude des relations entre distance génétique et distance physique ;
- la colinéarité entre génomes homéologues du blé et les relations de synténie avec d'autres céréales ;
- les relations entre structure et fonction et les conséquences en matière d'expression génique ;
- les mécanismes d'évolution des génomes (excision, duplication, transposition de gènes et d'éléments répétés...) dans un contexte polyploïde.