Gnet - IPS2

Acronyme ou nom de la structure
Nom complet (en toutes lettres)
Genomics Networks
Tutelle(s) institutionnelle(s) et affiliation/labelisation
Prénom et nom du responsable de l'équipe
Marie-Laure Martin-Magniette
E-mail de contact
martin@evry.inra.fr
Adresse

Equipe Genomic Networks (Gnet)
Paris-Saclay Institute of Plant Sciences (IPS2)
Bâtiment 630, rue de Noetzlin
Plateau du Moulon

91190 - Gif-sur-Yvette

France

Coordonnées GPS
48.7117632, 2.16831
Description

Le groupe de recherche Genomic Networks est composé de Bionformatiociens et Biostatisticiens travaillant pour développer de nouvelles approches en Génomique Végétale dans l'Institut des Sciences des Plantes de Paris-Sacalay (IPS2).Ces activités de recherche et d'ingénierie ont pour but d'améliorer l'annotation fonctionnelle des gènes d'Arabidopsis thaliana et de permettre des transferts vers d'autres modèles de plantes ayant un intéret agronomique. Nos projets sont découpés en 3 grands domaines :  la prédiction de réseaux de gènes liés aux stress des plantes, le développement de méthodes statictiques pour analyser les données omiques, et l'intégration de données.

Description (English)

The Genomic Networks group develops different Bioinformatic and Biostatistic approaches to infer the biological function of A. thaliana genes and transcriptional regulatory elements. We developped mainly 2 databases (FLAGdb++, CATdb) supporting the IPS2 Transcriptomic platform and projects. These databases are useful for comparative plant genomics and transfer of knowledge from model plant genomes to plants of agronomical interest. Using this tool, we study, in a multidisciplinary project, the transcriptional re-programming that occurs in the A. thaliana response to biotic and abiotic stresses in order to identify novel gene targets and establish networks in the perspective of biotechnological applications or genetic selection for plant stress resistance.

English keywords
Plant Genomics, Transcriptomic, Databases, Sequence annotation, regulatory networks
Type de structure
Equipe de recherche
Adhésion en tant que personne morale
Désactivé