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Identification et Analyse des Signaux de Codes Circulaires dans les Gènes par des Méthodes Bioinformatiques

TitreIdentification et Analyse des Signaux de Codes Circulaires dans les Gènes par des Méthodes Bioinformatiques
Type de publicationThèse
Nouvelles publications2009
AuteursAhmed, A
DirecteursMichel, Christian
Rapporteursd'Alché-Buc, Florence, Lecroq Thierry
ExaminateursContassot-Vivier, Sylvain, Schreck Pascal
Université et/ou école doctoraleUniversité de Strasbourg
DiplômeDoctorat
Résumé

Des travaux antérieurs ont montré que la distribution des trinucléotides dans les 3 phases des gènes (eucaryotes et procaryotes) n'est pas aléatoire et que chaque trinucléotide apparait préférentiellement dans l'une de ces 3 phases. Ainsi, 3 ensembles de 20 trinucléotides associés à chacune des 3 phases des gènes possèdent des propriétés biomathématiques étonnantes et rares, en particulier celle de code circulaire. Ces 3 codes circulaires permettent de retrouver chacune les 3 phases d'un gène, localement, en particulier la phase de lecture sans codon d'initiation, et automatiquement, avec une fenêtre de quelques nucléotides. Nos travaux de recherche ont permis d'identifier et d'analyser divers signaux associés à ces 3 codes circulaires dans des familles particulières de gènes : les fonctions cellulaires essentielles, les micro ARNs et les gènes à phase décalée.

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© SFBI, 2012 - Réalisation du site : Valentin Guignon, administration du site : Pierre Tufféry, directrice de publication : Sophie Schbath.

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