Ingénieur Systèmes & Réseaux - Plateforme Bioinformatique AP-HP

Type de poste
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Adresse

<p>33 bd Picpus, 75012 Paris</p>
Paris
France

Contacts
Alban Lermine
Camille Barette
Email du/des contacts
alban.lermine@aphp.fr
camille.barette@aphp.fr
Description

<p><u>Description du poste</u></p><p>&nbsp;</p><p>Ingénieur Systèmes et Réseaux</p><p>Plateforme bioinformatique de l&rsquo;Assistance Publique &ndash; Hôpitaux de Paris</p><p>&nbsp;</p><p><u>Description de l&rsquo;Assistance Publique &ndash; Hôpitaux de Paris</u></p><p>&nbsp;</p><p>L&#39;Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP - HP) est le centre hospitalier universitaire (CHU) d&rsquo;Île-De-France. Ses missions sont le soin, la recherche et l&rsquo;enseignement. À dimension internationale, il est constitué de 39 hôpitaux, organisés en 12 groupes hospitaliers. Accueillant plus de 7 millions de patients par an, il possède un budget annuel de près de 7,2 milliards d&rsquo;euros.</p><p>&nbsp;</p><p><u>Description de la plateforme bioinformatique de l&rsquo;AP-HP</u></p><p>&nbsp;</p><p>La plateforme bioinformatique de l&rsquo;AP-HP nouvellement construite est située au sein du département Web Innovation Données (WIND) de la Direction des Systèmes d&rsquo;Information (DSI) de l&rsquo;AP-HP, qui a pour mission d&#39;assister le Directeur Général du centre hospitalier universitaire d&rsquo;Île-de-France dans la conception, le pilotage, le soutien à l&rsquo;innovation et la mise en œuvre de la politique système d&rsquo;information de l&#39;AP-HP.</p><p>Dans ce contexte, la plateforme bioinformatique de l&rsquo;AP-HP s&rsquo;oriente vers l&rsquo;innovation, le monde du datamining, l&rsquo;analyse des données massives, et contribue à faire de la génétique un des axes de développement majeurs à l&rsquo;AP-HP. L&rsquo;avènement de la médecine personnalisée et prédictive, les innovations technologiques dans les domaines du séquençage et des systèmes d&rsquo;information, l&rsquo;augmentation significative de l&rsquo;activité de génétique en clinique ainsi que dans les projets de recherche, la transition progressive des panels de gènes vers l&rsquo;exome et le génome sont quelques-uns des nombreux enjeux justifiant le développement de la plateforme bioinformatique à l&rsquo;AP-HP.</p><p>Dans cette perspective, cette dernière a pour missions plurielles la centralisation progressive du stockage des données de génomique produites au niveau de 39 hôpitaux, leur analyse dans le cadre de processus maitrisés et normalisés, la mise à disposition d&rsquo;outils d&rsquo;exploitation des résultats, l&rsquo;animation d&#39;une communauté bioinformatique de l&rsquo;AP-HP regroupant plusieurs dizaines d&#39;ingénieurs, le support technique et scientifique ainsi que la formation, et la veille technologique en bioinformatique.</p><p>&nbsp;</p><p><u>Description des missions de l&rsquo;ingénieur Systèmes et réseaux</u></p><p>&nbsp;</p><p>Sous la hiérarchie du responsable HPC et Big Data de la plateforme bioinformatique de l&rsquo;AP-HP, le (la) candidat(e) aura les missions suivantes&nbsp;:</p><p>- maintenir en condition opérationnel l&rsquo;infrastructure HPC et le cluster Big Data&nbsp;;</p><p>- participer aux évolutions de la plateforme (conception, configuration et installation)&nbsp;;</p><p>- suivre et traiter les incidents survenant sur l&#39;infrastructure&nbsp;;</p><p>- interagir avec le département Infrastructure et Services pour les projets du département&nbsp;;</p><p>- assister les développeurs et intégrateurs à configurer et déployer leurs applications de bioinformatique&nbsp; et les &laquo;&nbsp;data-scientists&nbsp;&raquo; à utiliser les outils de calcul distribué&nbsp;;</p><p>- former et supporter les utilisateurs des ressources de calcul mises à disposition de la &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; communauté bioinformatique de l&rsquo;AP-HP&nbsp;;</p><p>- faire de la veille technologique dans le domaine des systèmes distribués et du Big data.</p><p>&nbsp;</p><p><u>Les compétences requises</u></p><p>&nbsp;</p><p>Le (la) candidat(e) devra disposer&nbsp;:</p><p>- un diplôme d&rsquo;ingénieur ou de formation universitaire équivalente en informatique&nbsp;;</p><p>- plus de 3 ans d&rsquo;expérience sous Linux&nbsp;;</p><p>- plus de 3 ans d&rsquo;expérience dans l&rsquo;implémentation et le design d&rsquo;infrastructure IT&nbsp;;</p><p>&nbsp;</p><p>Il est aussi attendu du (de la) candidat(e) d&rsquo;avoir au moins&nbsp;:</p><p>- une expérience dans l&rsquo;exploitation de grandes plateformes de données (idéalement Lustre)&nbsp;;</p><p>- une expérience dans l&rsquo;administration de cluster de calcul et/ou BigData&nbsp;;</p><p>- une expérience et compréhension des infrastructures virtuelles et/ou conteneurisées&nbsp;;</p><p>- connaissance approfondie des outils de supervision fonctionnant en mode distribué&nbsp;;</p><p>- expérience avec un outil de configuration automatisé.</p><p>&nbsp;</p><p>Un bon niveau d&rsquo;anglais (écrit, lu, parlé) est attendu.</p><p>&nbsp;</p><p>Enfin, nous recherchons avant tout une personne ayant d&rsquo;excellentes qualités relationnelles et organisationnelles, aimant travailler en équipe, et disposant d&rsquo;une adéquation avec les valeurs de l&rsquo;hôpital public, d&rsquo;une appétence pour les défis ambitieux, et d&rsquo;une sensibilité aux valeurs d&rsquo;intégrité scientifique.</p><p>&nbsp;</p><br/>
Laboratoire: Plateforme Bioinformatique AP-HP