LABGeM

Acronyme ou nom de la structure
Nom complet (en toutes lettres)
Laboratoire d'Analyses Bioinformatiques pour la Génomique et le Métabolisme
Tutelle(s) institutionnelle(s) et affiliation/labelisation
Prénom et nom du responsable de l'équipe
Claudine Médigue
E-mail de contact
cmedigue@genoscope.cns.fr
Adresse

France

Description

L’Atelier de Génomique Comparative est un groupe de bio-informatique dont le principal objectif consiste à mettre en oeuvre les moyens informatiques nécessaires à l’extraction des informations significatives des données de génomes de microorganismes aujourd’hui disponibles ou en cours de séquençage. Le groupe rassemble, pour l’essentiel, des biologistes de formation qui ont développé un goût prononcé pour l’informatique (dans ses facettes programmation et bases de données) et/ou pour la bio-analyse (exploration et interprétation de résultats d’analyse génomique). L’activité de l’AGC recouvre donc à la fois des développements informatiques (certains sont réalisés via des collaborations spécifiques avec des informaticiens, statisticiens et/ou mathématiciens), et des analyses biologiques de résultats obtenus avec des outils informatiques (développés par nos soins ou intégrés à notre environnement). L’interaction permanente avec les utilisateurs des outils que nous développons, i.e le plus souvent des biologistes ’de la paillasse’, est une activité primordiale au sein de l’AGC. Ces échanges, très nombreux et réguliers, nous permettent d’enrichir notre connaissance biologique des diverses bactéries étudiées. C’est aussi le moyen le plus efficace de faire évoluer notre plateforme d’annotation et d’analyse de génomes procaryotes, MicroScope, en y intégrant de nouvelles stratégies indispensables à l’annotation fonctionnelle des gènes, et des fonctionnalités, au sein de l’interface graphique MaGe(Magnifying Genome), destinées à l’exploration de données génomiques de nature souvent diverses.

Type de structure
Equipe de recherche
Adhésion en tant que personne morale
Désactivé