M2 - bio-informatique, Laboratoire de Virologie , Hôpital St Louis.

Type de poste: 
Durée du poste: 
6mois
Date de début: 
Ma, 15/01/2019
Ville: 
Paris
Laboratoire: 
Laboratoire de Virologie, Hôpital St Louis
Adresse: 

1, avenue Claude Vellefaux 75010 Paris

Nom et prénom du contact: 
RANGER Noémie
Email du contact: 
noemie [dot] ranger [at] aphp [dot] fr
Date de validité: 
30/01/2019
Description du poste: 

Le laboratoire de virologie, hôpital Saint-Louis, université Paris- Diderot, recherche un stagiaire en bio-informatique (Niveau M2) pour une durée de 6 mois sur l’année 2019.

  • Mission principale

Dans le cadre du développement de la métagénomique au laboratoire, nous recherchons un stagiaire pour :

-Participer à la création d’un pipeline pour l’analyse des données biologiques issues du séquençage haut-débit (virome). 

-Valider le pipeline sur des séries de données produites au laboratoire

  • Formation/Diplôme 

Master de Bio-informatique

  • Connaissances requises

-Maitrise de l’environnement UNIX/ LINUX et d’un langage de programmation (PYTHON,PERL, R, …) 

-Connaissance de la Plateforme Galaxy. 

-Connaissance des outils pour l’analyse des données NGS.