La mention Bioinformatique, Biochimie Structurale et Génomique articule deux spécialités, dont une spécialité recherche couvrant l’ensemble du domaine de la mention, et une spécialité professionnelle, en Génomique/Bioinformatique. La Bioinformatique, la biologie structurale, et la Génomique jouent un rôle prépondérant en Biologie, en particulier dans le développement d’approches fonctionnelles à haut débit (transcriptome, protéome, inter-actome, régulome).Le développement récent des méthodes de séquençage à grande échelle a conduit au décryptage de plus d’une centaine de génomes microbiens, animaux et végétaux. La caractérisation du polymorphisme et l’annotation détaillée de ces génomes est en cours, en s’appuyant sur le développement rapide de la bioinformatique. La Génomique fonctionnelle est encore une discipline en émergence. Elle vise à exploiter les données issues du séquençage des génomes, pour proposer des approches de caractérisation massive de l’expression génique, y compris la caractérisation des interactions contrôlant la majorité des processus biologiques. Ces nouvelles approches contribuent de plus en plus significativement à la caractérisation fonctionnelle des principaux composants des cellules pour de multiples organismes.Le développement rapide de la Biochimie structurale en a fait une discipline reconnue en tant que telle, dont l’objectif est de décrire la vie au travers de la structure des macromolécules et de leurs interactions.Initialement centrée sur l’analyse et la comparaison des séquences nucléiques et protéiques, la Bioinformatique intervient dans la plupart des disciplines biologiques. En effet, l’analyse des séquences biologiques est maintenant centrale pour un grand nombre d’études en Biochimie et en Biologie cellulaire. En outre, dans la foulée des développements en génomique fonctionnelle, de nouvelles applications émergent, en Biologie du développement, Neurobiologie, Immunologie...
Organisation :
M1 : Parcours généraliste au premier semestre (cours, TD, TP) ; enseignement interactif, enseignement spécialisant et stage ou projet au deuxième semestre ; exposition à l’anglais scientifique. Le premier semestre dure 13-14 semaines, est centré sur la formation approfondie dans les disciplines de base du master, contient des UE introductives aux principales disciplines couvertes par la mention, des options ,et des TP. Le deuxième semestre comprend des UE de spécialisation optionnelles, et surtout un stage ou un projet de recherche (entre 6 et 12 crédits). Des UE libres apportent des points de bonification.
M2 Recherche : deux semestres comprenant des UE au choix (semestre 1) et 1 stage en laboratoire de 6 mois (semestre 2), l’ensemble permettant une spécialisation.
M2 Professionnel : formation théorique au semestre 1 suivie d’un stage en entreprise au semestre 2 ; contacts avec l’environnement professionnel Des passerelles sont aménagées à tous les niveaux (interdisciplinaires mais aussi entre parcours recherche et professionnel) et l’étudiant a la possibilité de choisir sa spécialisation jusqu’à l’entrée en M2 Il existe des possibilités d’échanges d’UE avec d’autres mentions de masters ; certaines des UE réalisées à Luminy constituent des étapes obligatoires ou optionnelles d’autres parcours Le contact avec les laboratoires est établi dès le M1 à la fois sous forme de TER, de stages, et d’interventions de chercheurs.
La Mention s’appuie sur un réseau de laboratoires CNRS - INSERM essentiellement établi sur Marseille et sur un réseau d’entreprise réparti sur l’ensemble du territoire national.
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Responsables: M1: Bénédicte Wirth (benedicte.wirth@univ-provence.fr) James Sturgis (sturgis@ifr88.cnrs-mrs.fr), M2 (recherche): Hervé Darbon (Herve.Darbon@afmb.univ-mrs.fr), M2 (pro): Pascal Rihet (pascal.rihet@univmed.fr) & Pédro Coutinho (pedro.coutinho@afmb.univ-mrs.fr)