PFEM

Acronyme ou nom de la structure
Nom complet (en toutes lettres)
Plateforme d'Exploration du Métabolisme
Tutelle(s) institutionnelle(s) et affiliation/labelisation
Prénom et nom du responsable de l'équipe
Estelle Pujos-Guillot
E-mail de contact
pfem-msm@clermont.inra.fr
Adresse

Centre de recherche de Clermont-Ferrand / Theix

63122 Saint Genès Champanelle

France

Coordonnées GPS
45.712131, 3.015929
Description

La plateforme « Exploration du Métabolisme » ou PFEM est une infrastructure scientifique et technologique mettant à disposition de la communauté scientifique publique et privée, les concepts, les méthodes et les outils consacrés à l’étude du métabolisme, dans le domaine nutrition/santé. Elle constitue l'un des 4 noeuds de l' infrastructure nationale de métabolomique et fluxomique, MetaboHUB, créée en 2013. La structure Clermontoise utilise des techniques analytiques d’analyses globales comme la spectrométrie de masse couplée en chromatographie liquide ou gazeuse. En appui de ses activités analytiques, la PFEM développe une expertise en BioAnalyse et en BioInformatique.

Description : Le groupe "BioInformatique & Statistiques" s'intéresse au prétraitement (filtre et nettoyage de données), aux analyses descriptives et inférentielles des données et au développement de stratégies in silico d'identification et d'annotation dans le domaine de la métabolomique. Les compétences regroupées au sein de la PFEM en informatique, développement logiciel, statistiques, et bioinformatique sont à l'origine de projet comme PeakForest, librairie en ligne de profils metaboliques (peakforest.org) et permettent de collaborer activement à différents projets nationaux et internationaux (portail collaboratif workflow4metabolomics, MetabOlism FramewOrk , base de données PhytoHUB).

English keywords
bioinformatics, metabolomics, databases, workflows
Type de structure
Equipe de recherche
Adhésion en tant que personne morale
Désactivé