prix SFBI de la meilleure présentation orale à Jobim 2015

Bravo à Isaure Chauvot de Beauchêne qui a remporté ce premier prix décerné par la SFBI !

Plus d'infos sur sa présentation

Voici un résumé de la présentation:

Les liaisons spécifiques ARN-protéine sont impliquées dans une grande variété de processus cellulaires fondamentaux. Une description atomistique de ces processus de liaison aiderait la conception rationnelle de modulateurs pharmaceutiques de ces fonctions. Toutefois, le docking ARN-protéine est rendu difficile par la flexibilité et le large espace conformationnel des ARN, surtout pour les régions simple brin (ARNsb). Nous présentons une approche originale et efficace pour prédire avec précision la structure d'un ARNsb lié à une protéine, à partir de la structure de la protéine et la séquence de l'ARN. Nous utilisons une approche par fragments, en 3 étapes: (i) découpage de la séquence d'ARN en trinucleotides chevauchants, (ii) docking de chaque trinucleotide séparément sur la protéine, à l'aide d'un ensemble de fragments structuraux, et (iii) assemblage des poses spatialement compatibles. Sur deux complexes test comportant une séquence uniforme d'ARN, notre méthode a permis de définir le site de liaison sur la protéine à 10 Å près. En outre, la conformation liée de l'ARNsb a été approximée à ~ 3 Å près, une précision jamais approchée jusqu’à présent.

 

Le parcours d'Isaure:

Après des études de médecine vétérinaire (Lyon) et un master de pharmacologie (Paris V), j'ai effectué mon stage de M2 et ma thèse au LBPA (CNRS - ENS Cachan), sous la direction de Luba Tchertanov. J'ai étudié l'impact de mutation oncogènes plus ou moins résistantes aux anti-cancéreux du récepteur tyrosine kinase KIT, par prédiction de structure, docking, dynamique moléculaire et détection de chemins de communication allostériques dans la protéine. Je développe actuellement des méthodes de docking protéine-ARN et protéine-ADN dans le groupe de Martin Zacharias, à l’Université Technique de Munich.