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Unité de Recherche en Génomique Végétale

  • Génomique Végétale
  • Intégration
  • Réseau de régulation
  • annotation de séquences
  • transcriptomique
Acronyme du laboratoire: 
URGV
Tutelles institutionnelles du laboratoire: 
INRA, Université d'Evry Val d'Essonne UMR 1165
ERL CNRS 8196
Nom de l'équipe: 
Bioinformatic for Predictive Genomics
Taille de l'équipe: 
moins de 10
SFBI: 
Membre de la SFBI
Prénom et nom du responsable de l'équipe: 
Sébastien Aubourg
E-mail du responsable de l'équipe: 
aubourg@evry.inra.fr
Adresse: 

Unité de Recherche en Génomique Végétale - URGV,
UMR INRA 1165 - Université d'Evry Val d'Essonne -
ERL CNRS 8196,
2 rue Gaston Crémieux, CP 5708,
F-91057 Evry Cedex,
France

 

Ville: 
Evry
URL: 
http://www.versailles.inra.fr/urgv/bioinformatics.htm
Thèmes de recherche (sous la forme de mots-clés): 
annotation de séquences
Génomique Végétale
transcriptomique
Intégration
Réseau de régulation
English keywords: 
Plant Genomics, Transcriptomic, Databases, Sequence annotation, regulatory networks
Description: 

The bioinformatics group develops different approaches to infer the biological function of A. thaliana genes and transcriptional regulatory elements. We develop a dedicated public information system (FLAGdb++, CATdb, UTILLdb…) supporting the URGV genomic platforms and projects. These databases are useful for comparative plant genomics and transfer of knowledge from model plant genomes to plants of agronomical interest. Using this tool, we study, in a multidisciplinary project, the transcriptional re-programming that occurs in the A. thaliana response to biotic and abiotic stresses in order to identify novel gene targets and establish networks in the perspective of biotechnological applications or genetic selection for plant stress resistance.

Description (english): 

The bioinformatics group develops different approaches to infer the biological function of A. thaliana genes and transcriptional regulatory elements. We develop a dedicated public information system (FLAGdb++, CATdb, UTILLdb…) supporting the URGV genomic platforms and projects. These databases are useful for comparative plant genomics and transfer of knowledge from model plant genomes to plants of agronomical interest. Using this tool, we study, in a multidisciplinary project, the transcriptional re-programming that occurs in the A. thaliana response to biotic and abiotic stresses in order to identify novel gene targets and establish networks in the perspective of biotechnological applications or genetic selection for plant stress resistance.

© SFBI, 2012 - Réalisation du site : Valentin Guignon, administration du site : Pierre Tufféry, directrice de publication : Sophie Schbath.

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