Evènements

Title Date de début Date de fin Pays Ville Description Site web
MOOC BIG "BioInformatique pour la Génétique Médicale" 24-02-2020 04-05-2020 France FUN-MOOC

Le MOOC BiG “BioInformatique pour la Génétique médicale” a pour vocation d’aborder l’ensemble des aspects bioinformatiques nécessaires à la production et à l’interprétation de données du séquençage haut débit (SHD) ou Next Generation Sequencing (NGS) au sein d’un laboratoire de génétique médicale avec des exemples des maladies rares et de l'oncogénétique.
Début d'inscription: 30 décembre 2019
Fin d'inscription: 04 mai 2020
Début du cours: 24 fév 2020
Fin du cours: 04 mai 2020
Effort estimé: 02:30 h/semaine
Langue: Français

https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:USPC+37028+session01/about
MOOC "Recherche reproductible : principes méthodologiques pour une science transparente" 20-03-2020 20-03-2021 France FUN-MOOC

Ce cours est la 3ème session du Mooc « Recherche reproductible », ouvert pour une durée de un an et enrichi avec de nouveaux contenus.
- Markdown pour la prise de note structurée
- des Outils d'indexation (DocFetcher et ExifTool)
- Gitlab pour le suivi de version et le travail collaboratif
- Notebooks (jupyter, rstudio ou org-mode) pour combiner efficacement calcul, représentation et analyse des données

https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+self-paced/about
12ème assemblée ARAMIS-2020 "Visualisation de données" 09-04-2020 09-04-2020 France Saint-Etienne

ARAMIS est un lieu d'échange et de communication sous la forme d'un réseau d'administrateurs réseaux et système et de développeurs de la région Rhône-Auvergne.
L'assemblée ARAMIS-2020 aura lieu le jeudi 9 avril 2020 à l'École des mines de Saint-Etienne. Pour sa 12ème journée, ARAMIS a souhaité aborder la Visualisation de données.

https://aramis.resinfo.org/wiki/doku.php?id=pleniaires%3Apleniere9avril2020
Formation Analyse de données 14-04-2020 17-04-2020 France Paris

Bonjour à tous,

Face au confinement, Soladis lance un programme de formations en Visioconférence. En nous inspirant de nos modules de formation habituellement animés en sessions de 1 à 2 jours, nous avons subdivisé les programmes en sessions de 2h à 3h de mini-formations accessibles par vidéoconférence à des groupes de 2 à 5 participants.

SAVE THE DATE 📅 Soladis débute dans 2 semaines son programme de visioformations avec une première série dédiée à l’Utilisation d’Excel pour valoriser les données !

Ce module sera livré en 3 sessions :
➡ le 14 avril de 9h30 à 11h30 : Mettre en forme un tableau de données (bonnes pratiques, formats de cellules, réalisation de calculs simples, réalisation de conditions (si, ou, et)…
➡ le 15 avril de 9h30 à 11h30 : Faciliter la saisie dans un tableau de données (listes déroulante, mises en forme conditionnelles, réorganisation de l’écran,…)
➡ le 17 avril de 9h30 à 11h30: : Résumer l’information (tableaux croisés dynamiques, représentations graphiques)

Pour plus d’informations sur les tarifs et vous inscrire : contact@soladis.fr

🎦 Les visioformations Soladis se font aussi en intra-entreprise ! Vous souhaitez sensibiliser vos équipes à des thématiques statistiques ? Les monter en compétences sur des méthodes ou des concepts ? Nos formations Soladis Institute peuvent aussi être adaptées pour répondre à vos problématiques. N'hésitez pas à nous contacter!

https://www.soladisinstitute.fr/
48th European Mathematical Genetics Meeting 16-04-2020 17-04-2020 Suisse Lausanne

EMGM focusses on key areas of statistical genetics and genetic epidemiology: population genetics, complex trait genetics, causal inference, trait prediction and personalised health, omics (as biomarkers), imputation / fine-mapping / rare variants, gene-, tissue- and pathway-enrichment, family-based data, multi-trait methods, etc.
Important Dates:
Registration: 6 January – 3 April 2020
Early bird registration deadline: 6 March 2020
Abstract submission: 6 January – 18 February 2020
Notification of abstract acceptance: 28 February 2020

http://wp.unil.ch/emgm2020/
ICTE 2020 - International Congress on Transposable Elements 25-04-2020 28-04-2020 France Saint Malo

The French community of scientists interested in transposable elements (CNRS-Mobil-ET) and the French Society of Genetics (SFG) are happy to announce the 4th International Congress on Transposable Elements (ICTE 2020).  

The congress will be held on April 25-28, 2020 in St Malo (France) at the “Palais du Grand Large”. St Malo is a beautiful and well-preserved corsair city surrounded by a city wall from the XIIth century on the Channel coast. It is ~3h distant from Paris by train and 50 km from Mont St Michel.

https://icte2020.sciencesconf.org
Formation "Analyse avancée de séquences" (CBiB) 05-05-2020 07-05-2020 France Bordeaux

Le Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) organise une formation en Bio-informatique intitulée : "Analyse avancée de séquences".
Objectifs:
- Savoir rechercher des informations dans les banques de données
- Maîtriser les outils d'analyse de séquences tels que les alignements et savoir interpréter les résultats
- Maîtriser les formats et les analyses des nouvelles données issues du séquençage (NGS)
- Savoir utiliser l'environnement Galaxy

https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20025-Analyse-avancee-de-sequences.html?axe…
Introduction to openBIS (SIB course) 06-05-2020 06-05-2020 Suisse Lausanne

openBIS is a combined data management platform, Electronic Laboratory Notebook, and Inventory Management System. openBIS helps scientists meet requirements from funding agencies, journals, and academic institutions to publish data according to the FAIR data principles. Scientists can use openBIS to document their daily experimental or computational work, store any related experimental raw and derived data, and link everything to materials, samples and protocols stored in the lab inventory.
This 1-day course provides a general overview of openBIS, followed by a practical training session, for wet lab scientists.

https://www.sib.swiss/training/course/2020-05-openbis
Ecole thématique "Structure-Based Drug Design" du GGMM 11-05-2020 15-05-2020 France Paris

L’objectif de l’école est de présenter une des techniques phare employée dans le cadre de la conception de molécules biologiquement active par modélisation moléculaire : le "Structure-Based Drug Design". La philosophie de cette technique est de concevoir des molécules biologiquement actives en utilisant les connaissances structurales de la cible et en étudiant son interaction avec un ou plusieurs ligands.

https://et-ggmm2020.sciencesconf.org/
Formation "Introduction à Galaxy" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 14-05-2020 14-05-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
Formation "Analyse de données NGS sous Galaxy" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 15-05-2020 15-05-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
Summer school on simulation models - eX Modelo (2nd edition) 25-05-2020 29-05-2020 France Châtenay-sur-Seine

eX Modelo - 2nd edition - is a research school on the exploration of simulation models (sensitivity analysis, calibration, validation, etc.) that will be held from May 25 to 29, 2020 in a rural setting 1 hour from Paris. This thematic school is intended for postgraduate students, engineers, academic researchers and companies interested in modelling, whatever their scientific field. The objective is to teach participants to become autonomous in exploring their models, in a friendly environment.

https://exmodelo.org/
Formation "Bioinformatique - Langage R : Introduction" (CBiB) 26-05-2020 27-05-2020 France Bordeaux

Le Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) organise une formation en Bio-informatique intitulée : "Langage R : Introduction".
Objectifs:
- Acquérir les bases pour l'utilisation du langage R
- Savoir manipuler et visualiser grands ensembles de données biologiques

https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20029-Langage-R--introduction.html?axe=114
Formation "Analyse bioinfo/stat de données RNA-seq sous Galaxy" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 27-05-2020 29-05-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
Formation "Analyses NGS avec R" - CBiB 28-05-2020 29-05-2020 France Bordeaux

Le Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) organise une formation en Bio-informatique intitulée : "Analyses NGS avec R" à Bordeaux sur 2 jours (du jeudi 28 Mai 2020 au vendredi 29 Mai 2020).

https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20030-Analyses-NGS-avec-R.html?axe=114
MCEB - Mathematical and Computational Evolutionary Biology 01-06-2020 05-06-2020 France Montpellier

The goal of the MCEB conference (at its 12th edition) is to bring together scientists with diverse backgrounds to present recent advances and discuss open problems in the field of mathematical and computational evolutionary biology. The theme of this year's edition will be on "Climate Changes and their Impacts on Evolution”, in particular the preservation of biodiversity, the conservation of species, the study of ecosystems and their dynamics, and the reconstruction of major past changes of climate and living conditions on Earth.

http://www.lirmm.fr/mceb2020/
Formation "Analyses bioinformatiques avec Python" - CBiB 02-06-2020 06-06-2020 France Bordeaux

Le Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) organise une formation en Bio-informatique intitulée : "Analyses bioinformatiques avec Python". Cette formation introduira notamment les librairies Biopython, Numpy, Pandas et Matplotlib permettant la manipulation et l'analyse de données biologiques ainsi que la visualisation des résultats d'analyse.

https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20327-Analyses-bioinformatiques-avec-Python…
(JC)2BIM - Ecole thématique du GDR BIM (Bioinformatique Moléculaire) 08-06-2020 12-06-2020 France Nouan-le-Fuzelier (Loir et Cher)

Le GDR BIM (Bioinformatique Moléculaire) propose une école de bioinformatique sur les fondements statistiques, algorithmiques et combinatoires pour l’analyse des grandes masses de données de séquences, telles que les données produites par le séquençage à haut débit.

http://www.gdr-bim.cnrs.fr/?page_id=560
ChIP-seq, RNA-seq et Hi-C : traitement, analyse et visualisation de données 09-06-2020 12-06-2020 France Montpellier

Formation CNRS entreprise :
OBJECTIFS
- Savoir planifier une expérience simple de type ChIP-seq ou RNA-seq
- Savoir évaluer la qualité des données obtenues dans le cadre de la régulation des gènes (ChIP-seq) et de l'analyse du transcriptome (RNA-seq)
- Maîtriser les principales méthodes et outils d'analyse des données ChIP-seq et RNA-seq
- Savoir les visualiser dans un navigateur de génome et en extraire les coordonnées des pics enrichis
- Savoir manipuler et annoter les fichiers d'enrichissement (bedtools)
- Maîtriser les principales méthodes d'analyse des données Hi-C et de génération des cartes de contact chromosomique

https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20028-ChIP-seq%2C-RNA-seq-et-Hi-C--traiteme…
Formation "Métagénomique shotgun" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 15-06-2020 16-06-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
Symposium "Multidisciplinary Approaches in Cancer Research" 15-06-2020 16-06-2020 France Sophia Antipolis

Cancer is a complex group of diseases challenging science and medicine. Over the years, it has become evident that an integrated approach encompassing traditional disciplines such as biology, data science and statistics, computer science, applied mathematics, physics, chemistry, physio-pathology and medicine was mandatory to understand and classify cancers, and envision effective treatments. The Symposium “Multidisciplinary Approaches in Cancer Research” perfectly illustrates this perspective, as the two day program features leading experts from the aforementioned disciplines.

https://project.inria.fr/ucancer2020/
“From A to S: the FunctionS of Alternative Splicing” 22-06-2020 23-06-2020 France Paris

With this conference, we aim at bringing together theoreticians and experimentalists working on the subject of alternative splicing. Contributions dealing with the role of alternative splicing in cancer and in development, its impact on the 3D structures of proteins and their interactions, the emergence of new isoforms and splicing patterns in evolution, the identification and quantification of isoforms from massive amounts of heterogenous and sparse data, will be particularly welcome.

https://fas.sciencesconf.org/
ISQBP - Meeting of the International Society of Quantum Biology and Pharmacology 29-06-2020 01-07-2020 France Strasbourg

The International Society of Quantum Biology and Pharmacology (ISQBP) is a society that provides a forum for chemists, pharmacologists and biologists to discuss and extend the impact of computational methodologies in the fields of biology, chemistry, chemical biology, medicinal chemistry, pharmacology, bioinformatics, genomics and proteomics. To achieve this mission, the ISQBP organizes the biennial President's meeting.

https://isqbp2020.sciencesconf.org/
JOBIM 2020 30-06-2020 03-07-2020 France Montpellier Pour fêter leur 20ème anniversaire, les Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique reviennent à Montpellier (ville d'acceuil de la première édition en 2000) https://jobim2020.sciencesconf.org/
Bioinformatics Summer School - UCLouvain (Belgium) 06-07-2020 10-07-2020 Belgique Louvain This one-week intensive summer school in bioinformatics will focus on data analysis and high throughput biology, with a special focus on R/Bioconductor and its application to a wide range of topics across bioinformatics and computational biology. The course is intended for researchers who are familiar with omics experimental technologies and their applications in biology, have had some exposure with R, and who want to learn or expand their bioinformatics skills. https://uclouvain-cbio.github.io/BSS2020/
MSCX 2020 - VII Mediterranean School of Complex Networks 05-09-2020 12-09-2020 Italie Salina Island

We call for applications to the 7th Mediterranean School of Complex Networks to be held in Salina Island, Italy. The aim is to provide a theoretical background to students (Master, PhD) and young researchers in the field, with particular attention to current trends in Network Science.
Important dates:
31 March 2020 Early registration deadline (no payment needed at this stage)
15 April 2020 Notification of Acceptance
15 May 2020 Registration deadline (payment needed)
5-12 Sep 2020 Summer School

http://mediterraneanschoolcomplex.net/
WABI - 20th Workshop on Algorithms in BIoinformatics 07-09-2020 09-09-2020 Italie Pise

WABI is an international Conference covering research in algorithmic work in bioinformatics, computational biology and systems biology. The emphasis is mainly on discrete algorithms and machine-learning methods that address important problems in molecular biology, that are founded on sound models, that are computationally efficient, and that provide evidence of their potential usefulness in practice, preferably by testing on appropriately chosen simulated or real datasets

http://algo2020.di.unipi.it/WABI2020/
Formation "Annotation automatique de génomes bactériens" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 10-09-2020 10-09-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
Formation "Comparaison de génomes microbiens" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 11-09-2020 11-09-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
Formation "Métabarcoding 16S" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 21-09-2020 24-09-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings