Evènements

Title Date de début Date de fin Pays Ville Description Site web
2d édition de la formation metabarcoding ABiMS IFREMER⁩ Migale 02-12-2019 06-12-2019 France Roscoff

Nous avons le plaisir de vous annoncer la tenue d'une nouvelle session de formation à l'analyse de données metabarcoding en décembre prochain.

Celle-ci vous proposera :

une formation complète à l'outil FROGS sous Galaxy
un tutoriel sur l'utilisation de DADA2
l'intervention de plusieurs experts du domaine avec exposés thématiques
le tout sur 5j, du 2 au 6 décembre prochain
Cette semaine thématique est co-organisée entre l’équipe bioinformatique de l’IFREMER , la plateforme Migale de Jouy en Josas et la plate-forme ABiMS de la Station Biologique de Roscoff, qui accueillera la formation.

Retrouver les détails du programme ici :

http://tiny.ifremer.fr/formation-metabarcoding-2019

Si cette formation vous intéresse, merci de bien vouloir compléter le formulaire d'inscription (cf lien ci-dessus).

Patrick Durand - Laure Quintric - Erwan Corre

http://tiny.ifremer.fr/formation-metabarcoding-2019
CSBIO 2019 - 10th International Conference on Computational Systems-Biology and Bioinformatics 04-12-2019 07-12-2019 France Nice
CSBIO 2019
10th International Conference on Computational Systems-Biology and Bioinformatics

With the advancement in next-generation molecular technology in generating the high-throughput "omics" data, life science has come to the era of "big data". To extract biological knowledge from the data and translate it into benefits for society (e.g. better medicine and healthcare), novel and advanced computational tools are needed for data analysis.

The call for paper targets contribution in the field of computational approaches designed to face the challenges aroused by biological systems. It aims at giving an overview of the cutting-edge methods and tools to address biological systems.

CSBio 2019 would like to invite researchers and industrial counterparts to meet at this event to exchange ideas and stimulate research collaborations.

 

TOPICS OF INTEREST

Topics of interest include, but are not limited to:

- Adaptive computation in bioinformatics
- Bio-data visualization
- Bio-inspired computing
- Biological network reconstruction and analysis
- Biomarker discovery
- Disease classification
- DNA, RNA and protein sequence analysis
- Drug discovery and validation
- Epigenetics/epigenomics
- Formal validation of biological systems
- Functional genomics
- Gene expression analysis
- Medical and biomedical informatics
- Modeling and simulation of biological processes, pathways, etc.
- Molecular evolution and phylogeny
- Next-generation sequencing
- Parallel and distributed computing for life science
- Population genetics
- Proteomics & other omics
- Protein folding
- Translational bioinformatics
http://www.csbio.org/2019/
Journées seqBIM 16-12-2019 17-12-2019 France Marne-la-vallée

Nous avons le plaisir de vous annoncer l'organisation des journées SeqBIM 2019 à Marne-la-Vallée les 16 et 17 décembre prochains.

SeqBIM (anciennement sous le nom seqBio) constitue les journées annuelles du groupe de travail seqBIM, commun au GDR BIM (bioinformatique moléculaire) et au GDR IM (informatique mathématique). Elles portent notamment sur la combinatoire et l'algorithmique du texte ainsi que leurs applications à la bioinformatique. Cette réunion s'adresse aux chercheurs en informatique, statistiques, bioinformatique et biologie qui travaillent sur les séquences, vues comme objet combinatoire ou comme objet biologique.

Vous pouvez d'ors-et-déjà soumettre un résumé simple (1 page maximum) ou étendu (5 pages maximum). La soumission se fait via le site Easychair : https://easychair.org/conferences/?conf=seqbim2019

La date limite de soumission est le 7 novembre 2019. Plus d'informations sur le site des journées : http://seqbim.cnrs.fr/seqbim-2019/

Nouveauté cette année : indépendamment des travaux présentés, une session sera dédiée aux jeunes chercheuses et chercheurs, pour leur permettre de présenter succinctement (en quelques minutes) leurs projets de recherche, et de se faire connaître de la communauté. Il n’est pas nécessaire de soumettre un résumé pour participer à cette session.

L'inscription est gratuite mais *obligatoire* et se fait directement sur le site de l'événement jusqu'au 21 novembre : http://seqbim.cnrs.fr/seqbim-2019/inscription-seqbim-2019/

 

http://seqbim.cnrs.fr/seqbim-2019/
SMPGD'20 - Statistical Methods for Post Genomic data 23-01-2020 24-01-2020 France Paris

The 2020 edition of the Statistical Methods for Post Genomic data (SMPGD) workshop will take place at Institut Pasteur in Paris on 23-24 January. The workshop aim is to present works from mathematical to applied statistics, but also new areas in high throughput biology that could need new statistical developments.

 

https://smpgd2020.sciencesconf.org/

 

The 2020 edition is organized by the Bioinformatics and Biostatistics Hub (Institut Pasteur) and the main topics are: Evolution of inter-species interactions, Machine learning algorithms for computational biology, and Evolution and epidemiology.

 

The workshop will feature 4 keynote speakers:

 

 * Simona Cocco (Ecole des Neurosciences Paris Ile de France, Paris, http://www.paris-neuroscience.fr/en/chercheurs-non-enp/simona-cocco )

 * Julia Gog (University of Cambridge, Cambridge, UK http://www.damtp.cam.ac.uk/people/j.r.gog/ )

 * Louis Lambrechts (Institut Pasteur, Paris https://research.pasteur.fr/en/team/insect-virus-interactions/ )

* Laurent Jacob (CNRS, LBBE, Université Lyon 1, Lyon https://lbbe.univ-lyon1.fr/-Jacob-Laurent-.html )

 

Attendance is free, but registration is mandatory on the conference website. Registration deadline is January 7, 2020.

 

Submissions for posters and short talks are open and will close on November 15, 2019 at 23:59 pm. Abstracts selected for a short talk will be announced on December 15, 2019.

 

https://smpgd2020.sciencesconf.org/
W4E 2020 - Workflow4Metabolomics training course 03-02-2020 07-02-2020 Belgique Bruxelles

Analysez vos données avec Galaxy et l'infrastructure Workflow4metabolomics !

La prochaine session Workflow4Experimenters (W4E2020) aura lieu à Bruxelles - Belgique (du 3 au 7 février 2020). Pendant cette semaine de formation, (dispensée en Anglais), vous apprendrez à utiliser l’infrastructure W4M et analyserez vos propres données (LC-MS, GC-MS, ou RMN).

Les méthodes et outils seront présentés pendant les sessions du matin. Un tutorat sera organisé pendant les sessions de l’après-midi.

 

Conférences invitées : Dr S. Marr (Leibniz Institute of Plant Biochemistry, Allemagne), Dr R. Weber (Phenome Centre Birmingham, Grande Bretagne), Dr N. Poupin (Unité Toxalim, INRA Toulouse, France)

 

Comité scientifique: C. Delporte et P. Van Antwerpen (Université libre de Bruxelles),P. De Tullio (Université de Liège), B. Govaerts (Université Catholique de Louvain), Y. Guitton, J. Saint Vanne (Laberca, Nantes), C. Dalle, M. Pétéra, F Giacomoni (PFEM INRA, Clermont-Ferrand), G. Le Corguillé, (Abims, Roscoff), B. Diémé (PFEM Université Clermont Auvergne), F. Souard (Université de Grenoble), C. Canlet, J.F. Martin, M. Tremblay-Franco (Toxalim INRA, Toulouse)

Programme et pre-inscriptions :  https://workflow4metabolomics.org/w4e2020 (Date limite de pré-inscription 03/11/2019)

Plus d’informations : contact@workflow4metabolomics.org

https://workflow4metabolomics.org/w4e2020
Ecole thématique CNRS Single-cell 2020 22-03-2020 27-03-2020 France Roscoff L’école vise à expliquer et diffuser ces méthodes au sein de la communauté des ingenieurs et chercheurs, bio-informaticiens et statisticiens directement impliqués dans des projets de génomique fonctionnelle en cellule unique. Ce cours offre une formation complète incluant le choix de la technologie la mieux adaptée à la question biologique posée, la conception de l’expérience, le contrôle qualité et, notament les analyses bioinformatiques et statistiques associées. L’école sera basée sur une alternance de sessions théoriques et d’ateliers pratiques. https://www.france-bioinformatique.fr/en/evenements/ecole-single-cell-2020
EBI-W4M training: Introduction to Metabolomics Analysis 30-03-2020 02-04-2020 Royaume-Uni Cambridge

EBI-W4M training: Introduction to Metabolomics Analysis

This course will provide an introduction to metabolomics data analysis. It will focus on Liquid Chromatography – Mass Spectrometry techniques and will encompass a combination of lectures and practical sessions covering principles of experimental design, data standards and analysis. Participants will learn about data sharing of metabolomics data with the EMBL-EBI’s MetaboLights repository.

 

Practicals will explore each stage of data analysis using training datasets and use freely-available metabolomics tools accessed through the Workflow4Metabolomics platform. The content will allow participants to create their own open-source analysis workflows to process LC-MS data based on the examples used during the course.

 

This course is aimed at scientists new to the field of metabolomics who want to gain insights into the data analysis process. The course assumes little prior knowledge of using bioinformatics tools and the workflow platform covered will allow a wide-range of backgrounds to access the practical content. Ideal applicants will be those wanting to include metabolite profiling in their current research, either as they move into the field or in addition to other -omics data work they are currently engaged in.

Date: Monday 30 March - Thursday 2 April 2020

Venue: European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) - Wellcome Genome Campus, Hinxton, Cambridge,  CB10 1SD, United Kingdom

Application opens: Monday 23 September 2019

Application deadline: Friday 29 November 2019

Participation: Open application with selection / * * * Infos & Registration * * *

ContactMeredith Willmott Franck Giacomoni

Registration fee: £650 - Including meals and accommodation

https://www.ebi.ac.uk/training/events/2020/introduction-metabolomics-analysis-1
ICTE 2020 - International Congress on Transposable Elements 25-04-2020 28-04-2020 France Saint Malo

The French community of scientists interested in transposable elements (CNRS-Mobil-ET) and the French Society of Genetics (SFG) are happy to announce the 4th International Congress on Transposable Elements (ICTE 2020).  

The congress will be held on April 25-28, 2020 in St Malo (France) at the “Palais du Grand Large”. St Malo is a beautiful and well-preserved corsair city surrounded by a city wall from the XIIth century on the Channel coast. It is ~3h distant from Paris by train and 50 km from Mont St Michel.

Registration & information: https://icte2020.sciencesconf.org

Follow us on Twitter: #icte2020
Deadline for abstract submission: March 4, 2020.

Transposable (or mobile) genetic elements play a crucial role in the living world and are present in all domains of life. These jumping genes, originally thought to be a genetic curiosity, are now proving to be ubiquitous and immensely important. They have a profound influence on the structure and function of the genomes in all organisms they occupy. Discovered by Barbara McClintock (Nobel Prize of Medicine in 1983), transposable elements are central to all biological processes, with considerable implications in medicine and agriculture. Transposon research covers a broad spectrum of organisms and a large variety of biological processes and methodologies. The goal of ICTE 2020 is to provide a multidisciplinary forum for scientists from diverse fields such as biochemistry, structural biology, ecology, genomics, bioinformatics, plant biology, microbiology, neurobiology, aging research, or oncology. As previous editions of this congress, we hope that it will be a fertile ground to foster unconventional interactions and novel cross-disciplinary collaborations.

The sessions will present the latest findings in the field and encourage stimulating discussions on the following topics:
1) Transposable elements in genome evolution and adaptation
2) Transposable element control and epigenetics
3) Transposition mechanisms and applications
4) Transposable elements in health and diseases

Please help us to spread the word by forwarding to colleagues and trainees with an interest on this topic. We hope to see many of you at the meeting!
Join us in Saint Malo !

https://icte2020.sciencesconf.org
JOBIM 2020 30-06-2020 03-07-2020 France Montpellier Pour fêter leur 20ème anniversaire, les Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique reviennent à Montpellier (ville d'acceuil de la première édition en 2000) https://jobim2020.sciencesconf.org/
JOBIM 2021 04-05-2021 07-05-2021 France Paris JOBIM 2021 aura lieu à Paris, à l'Institut Pasteur. Attention aux dates exceptionnelles en mai !