Evènements

Title Date de début Date de fin Pays Ville Description Site web
MOOC BIG "BioInformatique pour la Génétique Médicale" 24-02-2020 04-05-2020 France FUN-MOOC

Le MOOC BiG “BioInformatique pour la Génétique médicale” a pour vocation d’aborder l’ensemble des aspects bioinformatiques nécessaires à la production et à l’interprétation de données du séquençage haut débit (SHD) ou Next Generation Sequencing (NGS) au sein d’un laboratoire de génétique médicale avec des exemples des maladies rares et de l'oncogénétique.
Début d'inscription: 30 décembre 2019
Fin d'inscription: 04 mai 2020
Début du cours: 24 fév 2020
Fin du cours: 04 mai 2020
Effort estimé: 02:30 h/semaine
Langue: Français

https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:USPC+37028+session01/about
MOOC "Recherche reproductible : principes méthodologiques pour une science transparente" 20-03-2020 20-03-2021 France FUN-MOOC

Ce cours est la 3ème session du Mooc « Recherche reproductible », ouvert pour une durée de un an et enrichi avec de nouveaux contenus.
- Markdown pour la prise de note structurée
- des Outils d'indexation (DocFetcher et ExifTool)
- Gitlab pour le suivi de version et le travail collaboratif
- Notebooks (jupyter, rstudio ou org-mode) pour combiner efficacement calcul, représentation et analyse des données

https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+self-paced/about
3DGenomics - Interdisciplinary School in 3D Genomics 29-03-2020 03-04-2020 France Aussois

This school aims at enhancing the communication between disciplines by training the next generation of researchers in 3D Genomics to state-of-the-art experimental, modelling, numerical and data analysis approaches.

https://3dgenomics2020.sciencesconf.org
EBI-W4M training: Introduction to Metabolomics Analysis 30-03-2020 02-04-2020 Royaume-Uni Cambridge

This course will provide an introduction to metabolomics data analysis. It will focus on Liquid Chromatography – Mass Spectrometry techniques and will encompass a combination of lectures and practical sessions covering principles of experimental design, data standards and analysis. Participants will learn about data sharing of metabolomics data with the EMBL-EBI’s MetaboLights repository.

https://www.ebi.ac.uk/training/events/2020/introduction-metabolomics-analysis-1
Formation "Analyse avancée de séquences" (CBiB) 05-05-2020 07-05-2020 France Bordeaux

Le Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) organise une formation en Bio-informatique intitulée : "Analyse avancée de séquences".
Objectifs:
- Savoir rechercher des informations dans les banques de données
- Maîtriser les outils d'analyse de séquences tels que les alignements et savoir interpréter les résultats
- Maîtriser les formats et les analyses des nouvelles données issues du séquençage (NGS)
- Savoir utiliser l'environnement Galaxy

https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20025-Analyse-avancee-de-sequences.html?axe…
Introduction to openBIS (SIB course) 06-05-2020 06-05-2020 Suisse Lausanne

openBIS is a combined data management platform, Electronic Laboratory Notebook, and Inventory Management System. openBIS helps scientists meet requirements from funding agencies, journals, and academic institutions to publish data according to the FAIR data principles. Scientists can use openBIS to document their daily experimental or computational work, store any related experimental raw and derived data, and link everything to materials, samples and protocols stored in the lab inventory.
This 1-day course provides a general overview of openBIS, followed by a practical training session, for wet lab scientists.

https://www.sib.swiss/training/course/2020-05-openbis
Ecole thématique "Structure-Based Drug Design" du GGMM 11-05-2020 15-05-2020 France Paris

L’objectif de l’école est de présenter une des techniques phare employée dans le cadre de la conception de molécules biologiquement active par modélisation moléculaire : le "Structure-Based Drug Design". La philosophie de cette technique est de concevoir des molécules biologiquement actives en utilisant les connaissances structurales de la cible et en étudiant son interaction avec un ou plusieurs ligands.

https://et-ggmm2020.sciencesconf.org/
Formation "Introduction à Galaxy" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 14-05-2020 14-05-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
Formation "Analyse de données NGS sous Galaxy" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 15-05-2020 15-05-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
Summer school on simulation models - eX Modelo (2nd edition) 25-05-2020 29-05-2020 France Châtenay-sur-Seine

eX Modelo - 2nd edition - is a research school on the exploration of simulation models (sensitivity analysis, calibration, validation, etc.) that will be held from May 25 to 29, 2020 in a rural setting 1 hour from Paris. This thematic school is intended for postgraduate students, engineers, academic researchers and companies interested in modelling, whatever their scientific field. The objective is to teach participants to become autonomous in exploring their models, in a friendly environment.

https://exmodelo.org/
Formation "Bioinformatique - Langage R : Introduction" (CBiB) 26-05-2020 27-05-2020 France Bordeaux

Le Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) organise une formation en Bio-informatique intitulée : "Langage R : Introduction".
Objectifs:
- Acquérir les bases pour l'utilisation du langage R
- Savoir manipuler et visualiser grands ensembles de données biologiques

https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20029-Langage-R--introduction.html?axe=114
Formation "Analyse bioinfo/stat de données RNA-seq sous Galaxy" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 27-05-2020 29-05-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
Formation "Analyses NGS avec R" - CBiB 28-05-2020 29-05-2020 France Bordeaux

Le Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) organise une formation en Bio-informatique intitulée : "Analyses NGS avec R" à Bordeaux sur 2 jours (du jeudi 28 Mai 2020 au vendredi 29 Mai 2020).

https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20030-Analyses-NGS-avec-R.html?axe=114
Formation "Analyses bioinformatiques avec Python" - CBiB 02-06-2020 06-06-2020 France Bordeaux

Le Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) organise une formation en Bio-informatique intitulée : "Analyses bioinformatiques avec Python". Cette formation introduira notamment les librairies Biopython, Numpy, Pandas et Matplotlib permettant la manipulation et l'analyse de données biologiques ainsi que la visualisation des résultats d'analyse.

https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20327-Analyses-bioinformatiques-avec-Python…
(JC)2BIM - Ecole thématique du GDR BIM (Bioinformatique Moléculaire) 08-06-2020 12-06-2020 France Nouan-le-Fuzelier (Loir et Cher)

Le GDR BIM (Bioinformatique Moléculaire) propose une école de bioinformatique sur les fondements statistiques, algorithmiques et combinatoires pour l’analyse des grandes masses de données de séquences, telles que les données produites par le séquençage à haut débit.

http://www.gdr-bim.cnrs.fr/?page_id=560
ChIP-seq, RNA-seq et Hi-C : traitement, analyse et visualisation de données 09-06-2020 12-06-2020 France Montpellier

Formation CNRS entreprise :
OBJECTIFS
- Savoir planifier une expérience simple de type ChIP-seq ou RNA-seq
- Savoir évaluer la qualité des données obtenues dans le cadre de la régulation des gènes (ChIP-seq) et de l'analyse du transcriptome (RNA-seq)
- Maîtriser les principales méthodes et outils d'analyse des données ChIP-seq et RNA-seq
- Savoir les visualiser dans un navigateur de génome et en extraire les coordonnées des pics enrichis
- Savoir manipuler et annoter les fichiers d'enrichissement (bedtools)
- Maîtriser les principales méthodes d'analyse des données Hi-C et de génération des cartes de contact chromosomique

https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20028-ChIP-seq%2C-RNA-seq-et-Hi-C--traiteme…
Formation "Métagénomique shotgun" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 15-06-2020 16-06-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
Bioinformatics Summer School - UCLouvain (Belgium) 06-07-2020 10-07-2020 Belgique Louvain This one-week intensive summer school in bioinformatics will focus on data analysis and high throughput biology, with a special focus on R/Bioconductor and its application to a wide range of topics across bioinformatics and computational biology. The course is intended for researchers who are familiar with omics experimental technologies and their applications in biology, have had some exposure with R, and who want to learn or expand their bioinformatics skills. https://uclouvain-cbio.github.io/BSS2020/
MSCX 2020 - VII Mediterranean School of Complex Networks 05-09-2020 12-09-2020 Italie Salina Island

We call for applications to the 7th Mediterranean School of Complex Networks to be held in Salina Island, Italy. The aim is to provide a theoretical background to students (Master, PhD) and young researchers in the field, with particular attention to current trends in Network Science.
Important dates:
31 March 2020 Early registration deadline (no payment needed at this stage)
15 April 2020 Notification of Acceptance
15 May 2020 Registration deadline (payment needed)
5-12 Sep 2020 Summer School

http://mediterraneanschoolcomplex.net/
Formation "Annotation automatique de génomes bactériens" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 10-09-2020 10-09-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
Formation "Comparaison de génomes microbiens" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 11-09-2020 11-09-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
Formation "Métabarcoding 16S" - cycle "Bioinformatique par la pratique" 2020 de la plateforme MIGALE 21-09-2020 24-09-2020 France Jouy-en-Josas

La plateforme MIGALE a ouvert son cycle de formation « Bioinformatique par la pratique » 2020.
Vous trouverez ci-dessous les modules disponibles : https://migale.inrae.fr/trainings

https://migale.inrae.fr/trainings
EBAII - 9ème école de bioinformatique AVIESAN - IFB - INSERM 04-10-2020 09-10-2020 France Roscoff

La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école aborde les nouveaux enjeux technologiques: elle s’articulera autour de trois ateliers thématiques en session parallèle (RNA-seq, ChIP-seq/ATAC-seq, variants DNA-seq), et inclura une introduction à l’intégration des données, une ouverture aux approches “single-cell” ainsi qu’aux technologies “long reads”.

https://www.france-bioinformatique.fr/en/evenements/ebaii2020