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2011. Etude structurelle des réseaux: modèles aléatoires, motifs et cycles. Université d'Evry. Habilitation à Diriger des Recherches Abstract
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2011. A la recherche des génomes perdus : modèles, méthodologies et algorithmes pour la comparaison de génomes. Universite Bordeaux I / Mathématiques et Informatique. Habilitation à Diriger des Recherches
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2011. Optimisation combinatoire dans les réseaux de fonctions de coût. INRA Toulouse. Habilitation à Diriger des Recherches Abstract
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2011. De l'art de résumer pour tenter de comprendre en génomique évolutive. Université d'Evry. Habilitation à Diriger des Recherches
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2011. L'analyse in silico des caractéristiques des protéines et de leurs interactions. Université Paris XI. Habilitation à Diriger des Recherches Abstract
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2011. Etude génomique des cancers. Université Paris Descartes / Ecole doctorale de médecine. habilitation à Diriger des Recherches
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2011. Algorithmes Haute-Performance pour la Reconnaissance de Formes Moléculaires. Université de Nancy. Habilitation à Diriger des Recherches
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2011. Les chromosomes ancestraux sont-ils des arrangements linéaires de gènes ? Habilitation à Diriger des Recherches
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2010. Simulations numériques de systèmes biologiques complexes ; dynamique, structure et fonction de transporteurs, canaux et enzymes. Université Denis Diderot - Paris 7. Habilitation à Diriger des Recherches Abstract
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2010. Large-scale in Silico Identification of Determinants of Protein Affinity and Promiscuity. Université d'Evry-Val d'Essonne. Habilitation à Diriger des Recherches