Applications et développements informatiques de protocoles de drug design et de criblage virtuel

Informations générales
Nom
Sperandio
Prénom
Olivier
Diplôme
Thèse
Année
2007
Détails de la thèse/HDR
Jury
Ronan Bureau
Alexandre Varnek
Michel Vidal
Romano Kroemer
Pierre Tuffery
Directeur (pour les thèses)
Bruno Villoutreix
Résumé en français
Cette thèse de chemoinformatique et bioinformatique structurale s’inscrit dans l’optimisation du processus d’identification de molécules à visée thérapeutique. Elle cible les trois composantes du criblage virtuel de composés chimiques : la préparation d’une version informatique de la chimiothèque ; l’identification de nouveaux composés par similarité avec des ligands actifs (LBVS) ; et l’identification de nouveaux composés actifs à partir de la structure 3D de la cible (SBVS). Ces travaux ont consisté à : créer un programme (MED-3DMC) de génération d’ensembles de conformères 3D de petites molécules ; créer un programme LBVS (MED-SuMoLig) qui permet, à partir d’un ligand actif, de cribler une chimiothèque de plusieurs milliers de composés sur la base de leur profil pharmaco-topologique ; et enfin appliquer des protocoles de criblage virtuel SBVS hiérarchique afin d’identifier des inhibiteurs d’interaction protéine-membrane avec le facteur Va de la coagulation comme preuve du concept.