Identification et Analyse des Signaux de Codes Circulaires dans les Gènes par des Méthodes Bioinformatiques

Informations générales
Nom
Ahmed
Diplôme
Thèse
Année
2009
Détails de la thèse/HDR
Jury
Florence d'Alché-Buc
Thierry Lecroq
Sylvain Contassot-Vivier
Pascal Schreck
Directeur (pour les thèses)
Christian Michel
Résumé en français
Des travaux antérieurs ont montré que la distribution des trinucléotides dans les 3 phases des gènes (eucaryotes et procaryotes) n'est pas aléatoire et que chaque trinucléotide apparait préférentiellement dans l'une de ces 3 phases. Ainsi, 3 ensembles de 20 trinucléotides associés à chacune des 3 phases des gènes possèdent des propriétés biomathématiques étonnantes et rares, en particulier celle de code circulaire. Ces 3 codes circulaires permettent de retrouver chacune les 3 phases d'un gène, localement, en particulier la phase de lecture sans codon d'initiation, et automatiquement, avec une fenêtre de quelques nucléotides. Nos travaux de recherche ont permis d'identifier et d'analyser divers signaux associés à ces 3 codes circulaires dans des familles particulières de gènes : les fonctions cellulaires essentielles, les micro ARNs et les gènes à phase décalée.