Réarrangements chromosomiques dans les génomes de mammifères : caractérisation des points de cassure

Informations générales
Nom
Lemaitre
Prénom
Claire
Diplôme
Thèse
Année
2008
Détails de la thèse/HDR
Université
Jury
Nicolas Galtier
Roderic Guigo
Eric Rivals
Pierre CAPY
Hubert Pinon
Directeur (pour les thèses)
Marie-France Sagot
Christian Gautier
Résumé en français
Les réarrangements chromosomiques sont des mutations qui modifient la structure et l'organisation des génomes. Ils sont ici étudiés dans le cadre de l'évolution des génomes de mammifères. L'objectif de ces travaux est de caractériser les régions du génome qui ont subit de tels évènements; elles sont appelées des points de cassure. Dans un premier temps, nous avons développé une méthode permettant d'identifier précisément ces régions sur un génome par comparaison avec un génome d'espèce différente. Nous montrons qu'elle améliore nettement la résolution par rapport aux méthodes existantes. Cela permet, dans un deuxième temps, d'analyser le contenu des séquences de points de cassure et leur répartition le long du génome. Plusieurs caractéristiques de séquences ont ainsi été identifiées dans les points de cassure chez l'homme, comme la perte de similarité avec les génomes comparés et la présence de duplications et d'éléments transposables. Enfin, nous montrons que les points de cassure ne sont pas répartis uniformément le long du génome, mais leur localisation serait fortement influencée par l'organisation des gènes et la structuration du génome en isochores.