Bioinformaticien / Biostatisticien - Spécialiste scRNA-Seq

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

8B, avenue Descartes
92350 Le Plessis Robinson
France

Contacts
Sébastien Henne
Virginie Chesnais
Email du/des contacts
shenne@lifeandsoft.com
vchesnais@lifeandsoft.com
Description

 

Contexte

Les avancées dans le domaine de la biologie permettent aujourd’hui des analyses au niveau cellulaire et offrent aux chercheurs des outils puissants pour étudier l'hétérogénéité des systèmes biologiques. Associées aux nouvelles technologies de séquençage, il est désormais possible de mesurer la diversité de l’expression des gènes au niveau d’une cellule grâce aux techniques de single-cell RNA Seq (scRNA-Seq).

Dans le cadre de son offre de service en recherche et développement, Life and Soft souhaite renforcer ses compétences en études transcriptomiques basées sur la technologie scRNA-Seq. Auprès de nos clients, vous serez impliqué dans la réalisation des différentes taches de bioinformatique et biostatistique nécessaires à l’exploitation des données scRNA-Seq :

  • Conception et implémentation des workflows de traitement des données de scRNA-Seq (Suite logiciel 10X Genomics).
  • Interprétation des données de scRNA-Seq: identification et comparaison de clusters, analyse d’expression...
  • Reporting des résultats, rédaction de rapports d’analyses.

En rejoignant Life and Soft, vous aurez également la possibilité de prendre une part active aux développements de nos méthodes et logiciels, dans le cadre de nos activités internes de recherche et développement.

Compétences requises

  • Outils bioinformatique : STAR, Seurat, connaissance des suites standards d’exploitation des données NGS, une première expérience avec la technologie 10X Genomics serait un plus.
  • Méthodes statistiques : PCA, analyses tSNE
  • Programmation : Python, R, Bash script, KNIME.
  • Gestion de code source avec Git
  • Environnement francophone. Anglais professionnel et technique indispensable.

Formation/Expérience

Master ou Doctorat en Biologie/Bioinformatique/Biostatistiques.

Expérience d’au moins un an dans l’exploitation de données de transcriptomique issue de scRNA-Seq.

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