M1 - Apport de l’analyse protéomique dans les réactions post-transfusionnelles plaquettaires

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat renouvelable
Détails de renouvellement
Stage de MASTER 2 en ALTERNANCE
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

25, boulevard Pasteur, 42023 SAINT-ETIENNE.
Laboratoire d’accueil : GIMAP/EA3064, Faculté de Médecine Jacques Lisfranc, Université de Lyon-Saint Etienne
42023 Saint-Etienne
France

Contacts
sandrine LARADI
Email du/des contacts
sandrine.laradi@efs.sante.fr
Description

Titre : Apport de l’analyse protéomique dans les réactions post-transfusionnelles plaquettaires

Structure d’accueil : EFS Rhône-Alpes-Auvergne,
Département scientifique, Site de Saint Etienne.
Equipe « Plaquettes et inflammation / Transfusion »
25, boulevard Pasteur, 42023 SAINT-ETIENNE.

Laboratoire d’accueil : GIMAP/EA3064
Faculté de Médecine Jacques Lisfranc
Université de Lyon-Saint Etienne , Campus Santé Innovations
10 rue de la Marandière
42270 Saint-Priest-en-Jarez

Tuteur scientifique :
Sandrine Laradi (PharmD, PhD, HDR) : sandrine.laradi@univ-st-etienne.fr sandrine.laradi@efs;sante.fr
Tel : 00 33 4 77 53 54 91

Mots clés : Plaquettes, Protéomique, Bio-informatique, Réaction post-transfusionnelle.
Descriptif du projet :
Nous nous intéressons aux plaquettes sanguines. Ces cellules non nucléées du sang circulant, surtout connues pour leur rôle indispensable dans l’hémostase primaire, possèdent aussi des fonctions pro inflammatoires, en grande partie liées à la présence d’une machinerie cellulaire permettant une signalisation intracellulaire et la production de cytokines, chimiokines et apparentées.
Ainsi un certain nombre de ces molécules semblent impliquées dans les réactions immunitaires post transfusionnelles de concentrés de plaquettes (CP). Nous nous intéressons à ces réactions.

Nous avons choisi une stratégie d’étude protéomique plaquettaire. Son interprétation fonctionnelle bio-informatique en situation de réaction post-transfusionnelle (dite « Effet Indésirable Receveur » ; EIR) permettra de mettre en évidence de nouvelles voies de régulation pour mieux expliquer la problématique d’apparition d’un EIR post transfusion plaquettaire et ainsi contribuer à une meilleure sécurisation de la transfusion. A partir de poches de CP collectées/ versus contrôles, l’analyse protéomique semi-quantitative dite Label free a été réalisée via un système ESI/LC :MS-MS (Protéome Centre Genomique Fonctionnelle, Université Bordeaux Segalen).
Sur la base de ces données protéomiques, l’étudiant(e) sera en charge d’identifier des protéines d’intérêt significativement sous ou sur-exprimés impliqués dans des voies de signalisation de l’activité plaquettaire dans les poches de CP, et en particulier lors des EIR.
Il s’agit d’un stage M1 basé sur l’analyse et l’interprétation de données protéomiques (RNAseq) de plaquettes sanguines en situation de réaction post-transfusionnelle.
Nous avons actuellement dans le laboratoire, une étudiante en Master 2 de Bio-informatique de Lyon 1, en contrat d’alternance.
Dans le but de poursuivre le travail entrepris par cette alternante, un nouveau contrat d’alternance est envisageable pour l’année 2019/20 en année de Master 2 dans le but de poursuivre les études.
Pour cela, une connaissance en techniques de laboratoire serait un plus –sans être un critère obligatoire.

10 publications récentes de l’équipe :
1. COGNASSE F, SUT C, FROMONT E, LARADI S, HAMZEH-COGNASSE H, GARRAUD O. Platelet soluble CD40-ligand level is associated with transfusion adverse reactions in a mixed threshold-and-hit model. Blood. 2017 Sep 14;130(11):1380-1383.

2. ALOUI C, CHAKROUN T, PRIGENT A, JEMNI-YACOUB, COGNASSE F, LARADI S, GARRAUD O. Leukocyte cytokines dominate over platelet cytokines overtime in non-leukoreduced platelet components. Blood Transfus. 2016 Sep 8:1-10. doi: 10.2450/2016.0076-16.

3. ALOUI C, PRIGENT A, TARIKET S, SUT C, FAGAN J, COGNASSE F, CHAKROUN T, GARRAUD O, LARADI S. Levels of human platelet-derived soluble CD40 ligand depend on haplotypes of CD40LG-CD40-ITGA2. Sci Rep. 2016 Apr 20; 6:24715. doi: 10.1038/srep24715.

4. TARIKET S, SUT C, HAMZEH-COGNASSE H, LARADI S, POZZETTO B, GARRAUD O, COGNASSE. Transfusion-related acute lung injury: transfusion, platelets and biological response modifiers. Expert Rev Hematol. 2016 May;9(5):497-508. doi: 10.1586/17474086.2016.1152177.

5. COGNASSE F, GARRAUD O, POZZETTO B, LARADI S, HAMZEH-COGNASSE H. How can non-nucleated platelets be so smart? J Thromb Haemost. 2016 Apr;14(4):794-6. doi: 10.1111/jth.13262.

6. COGNASSE F, HAMZEH-COGNASSE H, LARADI S, CHOU ML, SEGHATCHIAN J, BURNOUF T, BOULANGER C, GARRAUD O, AMABILE N. The role of microparticles in inflammation and transfusion: A concise review. Transfus Apher Sci. 2015 Oct;53(2):159-67. doi: 10.1016/j.transci.2015.10.013.

7. ALOUI C, SUT C, COGNASSE F, GRANADOS V, HASSINE M, CHAKROUN T, GARRAUD O, LARADI S. Development of a highly resolutive method, using a double quadruplex tetra-primer-ARMS-PCR coupled with capillary electrophoresis to study CD40LG polymorphisms. Mol Cell Probes. 2015 Dec;29(6):335-42. doi: 10.1016/j.mcp.2015.11.003

8. COGNASSE F, ALOUI C, ANH NGUYEN K, HAMZEH-COGNASSE H, FAGAN J, ARTHAUD CA, EYRAUD MA, SEBBAN M, FROMONT E, POZZETTO B, LARADI S, GARRAUD O. Platelet components associated with adverse reactions: predictive value of mitochondrial DNA relative to biological response modifiers. Transfusion. 2015 Oct 7. doi: 10.1111/trf.13373.

9. HAMZEH-COGNASSE H, LARADI S, OSSELAER JC, COGNASSE F, GARRAUD O. Amotosalen-HCl-UVA pathogen reduction does not alter poststorage metabolism of soluble CD40 ligand, Ox40 ligand and interkeukin-27, the cytokines that generally associate with serious adverse events. Vox Sang. 2015; 108 (2): 205-7. doi: 10.1111/vox.12203.

10. ALOUI C, SUT C, PRIGENT A, FAGAN J, COGNASSE F, GRANADOS-HERBEPIN V, TOURAINE R, POZZETTO B, AOUNI M, FENDRI C, HASSINE M, CHAKROUN T, JEMNI-YACOUB S, GARRAUD O, LARADI S. Are polymorphisms of the immunoregulatory factor CD40LG implicated in acute transfusion reactions? Sci Rep. 2014. Nov 28;4:7239. doi: 10.1038/srep07239.