Annotation manuelle de textes scientifiques en anglais

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

Domaine de Vilvert
78352 Jouy-en-Josas
France

Contacts
Louise Deléger
Claire Nédellec
Robert Bossy
Email du/des contacts
Louise.Deleger@inra.fr
Claire.Nedellec@inra.fr
Robert.Bossy@inra.fr
Description

L’équipe Bibliome de l’unité MaIAGE (INRA) recherche un annotateur à temps plein ou partiel pour l’annotation manuelle de textes scientifiques de biologie.

Contexte

L’équipe de recherche Bibliome développe des méthodes d’extraction d’information basées sur des ontologies, à partir de textes en langue naturelle.

Dans le cadre de la préparation de la tâche Bacteria Biotopes pour le challenge d’extraction d’information BioNLP-OST, l’équipe Bibliome développe un corpus public de textes annotés dans le domaine de la biodiversité microbienne (résumés et extraits d’articles scientifiques, pages web). L’équipe Bibliome a déjà organisé des tâches similaires lors des challenges BioNLP-ST 2011, 2013 et 2016 (Bossy et al., BMC Bioinformatics 2015). Ces tâches connaissent un succès croissant et les données associées sont reconnues pour leur excellence et leur originalité.

Description

La mission de la personne recrutée sera d’annoter des entités nommées d’intérêt (bactéries, habitats, phénotypes) et leurs relations (une bactérie vit dans un habitat, une bactérie présente un phénotype), et de faire le lien entre ces entités et des bases de connaissances spécifiques existantes (taxonomie, ontologie).
L’annotation se fera en équipe à l’aide d’un logiciel collaboratif dédié et selon des consignes d’annotation détaillées, pour lesquels la personne recrutée sera formée.

Compétences

  • maîtrise de la langue anglaise
  • grande rigueur
  • aptitude pour le travail en équipe
  • intérêt pour l’information scientifique et technique
  • une expérience en annotation manuelle de textes serait un plus
  • des connaissances en TAL / linguistique / ingénierie de la connaissance / IST seraient un plus
  • des connaissances en microbiologie seraient un plus.

Durée : 2 à 3 mois. Prolongation possible.

Date : dès que possible

Rémunération : selon profil, en référence à la grille de salaire des titulaires