Ingénieur en bioinformatique – Analyses de données NGS

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

46 Allée d’Italie
69364 Lyon 07
France

Contacts
Roudier François
Email du/des contacts
francois.roudier@ens-lyon.fr
Description

Un poste d'Ingénieur en Bioinformatique (niveau BAC +5), est ouvert dans l'équipe «Epigénétique, Chromatine et Développement» dirigée par François Roudier au sein de l'Unité Mixte de Recherche CNRS 5667 - INRA - ENS de Lyon - UCBL1. Les travaux menés dans l’équipe visent à caractériser le rôle des mécanismes chromatiniens et processus épigénétiques impliqués dans la régulation des programmes de développement, notamment dans la différenciation cellulaire au sein des méristèmes apicaux d’Arabidopsis thaliana.

Le (la) candidat(e) retenu(e) aura pour mission :
- l’analyse bioinformatique (et statistique) des données (épi)génomiques issues de séquençage haut-débit (ChIP-seq, ATAC-seq, RNA-seq, …) générées ou exploitées par les biologistes de l’équipe
- le stockage et la visualisation des données génomiques
- l’utilisation d’outils computationnels préexistants, leur adaptation et éventuellement le développement de nouveaux outils bioinformatiques
- la mise en forme des analyses réalisées et des résultats obtenus ainsi que leur restitution didactique
- le conseil et le soutien bio-informatique auprès des biologistes de l'équipe
- la veille scientifique sur les méthodes du domaine

Compétences requises :
- Diplôme d’Ingénieur ou Master en Bioinformatique/analyses computationnelles
- Maîtrise de langages de programmation (python, R, …) et de scripts (Bash, Awk, …)
- Expérience significative dans l'analyse de données (épi)génomiques issues de séquençage haut-débit
- Notions de statistiques appliquées à la génomique
- Maîtrise de l'anglais scientifique et technique
- Capacités organisationnelles, autonomie, rigueur et adaptabilité
- Capacité d’interaction aussi bien avec des biologistes que des informaticiens, esprit d’équipe

Date de prise de fonction : immédiate
Durée : 12 mois (renouvelable)
Rémunération : Selon grille de la fonction publique et expérience

Pour postuler, envoyez une lettre de motivation décrivant vos expériences précédentes, un CV ainsi que les coordonnées de deux références à l’adresse suivante : francois.roudier@ens-lyon.fr