Ingénieur en bio-informatique (H/F) - Brest - IFREMER

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

Technopôle Brest Iroise
29280 PLOUZANE
France

Contacts
Patrick Durand
Email du/des contacts
Patrick.Guido.Durand@ifremer.fr
Description

Missions principales

Ce poste vise à renforcer la capacité du service de bio-informatique à répondre aux sollicitations des projets scientifiques émanant d’une des unités utilisatrices dans les domaines du méta-barcoding et de la méta-génomique. Il s’agit donc d’une activité de support « projets » aux unités de recherche de l’IFREMER et de ses UMRs.

Les activités d’Ifremer amènent très souvent à réaliser des prélèvements, qu’il faut ensuite analyser (par ex : ADN environnemental) ; les techniques bio-informatiques répondant à cet objectif peuvent donc apporter un plus à ce processus.

Elle/ Il aura pour mission principale de participer à l’analyse de données environnementales (metabarcoding, metagenomique) en relation avec les équipes de recherche de l’Ifremer.

Activités principales

Gestion de projets bioinformatique en lien avec les laboratoires de recherches,

Mutualisation, au sein du Service Bioinformatique, des moyens informatiques et des méthodes d’analyse de données bioinformatiques,

Accompagnement des équipes de recherche de l’institut dans l’utilisation des services du service de Bioinformatique :

- En participant au support des analyses de données de type metabarcoding et metagenomique

- En sélectionnant et mettant au point des pipelines d’analyses adaptés aux projets pris en charge

- En préparant et en animant les formations thématiques à destination des équipes de recherche.

Champs relationnel

En interne :

Membres du Service de Bioinformatique gérant les ressources bioinformatiques de l’Ifremer.

Unités Ifremer de recherche utilisatrices des outils d’analyse « omiques ».

En externe :

Plateformes bio-informatiques françaises,

Scientifiques des UMRs qui collaborent avec l'Ifremer.

Profil recherché

Bac +5 minimum en bio-informatique ou bio-statistique avec compétences en analyse de données omiques ou équivalent.

2-3 ans d’expérience nécessaire en analyse de données environnementales.

Compétences mises en œuvre

Compétences techniques / métiers

- Connaissances en analyse de données de métabarcoding et métagénomique

- Connaissances en écologie des communautés et écosystèmes

- Système d’exploitation Unix/Linux, connaissance des clusters de calcul

- Aptitude à programmer des scripts d’analyse pour cluster de calcul

- Des connaissances en analyses statistiques serait un plus (maîtrise de R)

- Bon niveau d’anglais

Qualités personnelles

- Très bonne organisation et autonomie

- Aisance relationnelle et sens du service

- Disponibilité et capacité à travailler en équipe

- Capacité d'analyse, esprit de synthèse, dynamisme

- Bonnes aptitudes à la communication et à la présentation écrite et orale (En français et en anglais)

CDI-Temps plein.

Pour postuler : il faut impérativement déposer son dossier sur le site web de l'IFREMER, cf URL de la présente annonce.

Date de clôture de réception de candidatures : 13/03/2019

Toutes nos candidatures sont traitées exclusivement via notre site Carrières.