Responsable Réseau Grand Ouest de mutualisation et standardisation de données biomédicales

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Adresse

IRISA, UMR CNRS 6074
Campus de Beaulieu
35042 Rennes
France

Contacts
Camille Maumet
Alban Gaignard
Anne Siegel
Christian Barillot
Richard Redon
Email du/des contacts
camille.maumet@inria.fr
alban.gaignard@univ-nantes.fr
anne.siegel@irisa.fr
christian.barillot@irisa.fr
richard.redon@univ-nantes.fr
Description

** Missions **
Les recherches explorant le domaine du vivant sont confrontées de manière croissante au besoin de devoir lier des données de phénotypage et de génotypage. Ces données de génomique et d’imagerie in-vitro, in-vivo sont aujourd'hui pour la plupart exploitées “en silos”, c’est-à-dire sans moyen de pouvoir réaliser des analyses fines sur leurs complémentarités. Des initiatives de mutualisation et de standardisation au travers de grandes infrastructures de recherche émergent actuellement pour envisager à terme une exploitation algorithmique et statistique conjointe de ces diverses sources de données. La personne recrutée aura pour mission de s’appuyer sur les résultats de ces différentes initiatives pour établir un état des lieux des acteurs et des infrastructures disponibles à l’échelle du Grand-Ouest (région Bretagne et Pays de la Loire) et tester différents scenari et démonstrateurs technologiques pour la gestion, l’analyse et la réutilisation de données multi-infrastructures (imagerie in-vivo, in-vitro, génomique).

** Activités principales **
Animation de réseau scientifique ; Développement logiciel. Mise en place de réseau scientifique et de démonstrateur logiciel pour l’intégration de données de bioimagerie et de bioinformatique.

** Activités associées **
Organisation de rencontre scientifique, développement de démonstrateur.

** Connaissances **
Données et sciences du vivant, génomique et/ou bioimagerie.

** Aptitudes **
Capacité à interagir avec des acteurs de différentes cultures scientifiques, Développement de pipelines, développement logiciel

** Spécificités **
Accueil dans l’équipe Visages de l’IRISA. Visites régulières à prévoir à Nantes.

** Expérience souhaitée **
Stage de master. Intégration de données.