Computational scientist

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

21 Rue Jean Mazen
21000 DIJON
France

Contacts
Thierry Billoué
Email du/des contacts
tbilloue@oncodesign.com
Description

Oncodesign Biotechnology (www.oncodesign.com) a pour mission la découverte de nouvelles molécules thérapeutiques contre les cancers et autres maladies graves sans traitement efficace connu.
OncoSNIPE est notre programme stratégique de recherche et développement ayant pour objectif le développement d’outils de diagnostic et de recherche de nouvelles cibles thérapeutiques pour les patients résistants aux traitement anticancéreux.
A travers OncoSNIPE®, notre ambition est d’ouvrir la voie à la médecine de précision pour vaincre le cancer.

C’est dans ce cadre qu’Oncodesign recrute plusieurs Data Scientist/computational scientist (H/F) pour des postes basés à Dijon (21).

Quel sera mon rôle ?
Rattaché au laboratoire de Data Sciences, vous travaillerez en étroite collaboration avec les partenaires cliniques et industriels du projet OncoSNIPE et au sein d'une équipe projet transverse.
Vous serez chargé du développement et de la mise en œuvre des méthodologies des approches d'enrichissement de données et de réduction de dimension.
Vous serez responsable de l'intégration des données complexes hétéro-modales (RNA-seq, Exom-seq, micro-arrays, a-CGH, Imagerie) issues de modèles précliniques et/ou d’échantillons de patients et l'agrégation des connaissances biologiques (voies et réseaux de signalisation).

Quelles seront mes activités et mes champs d’expertise ?
Vous construisez et exploitez des outils d'intégration et de représentation des connaissances biologiques
Vous construisez et exploitez des pipelines analytiques à partir de l’analyse de données NGS.
Vous programmez en Python et/ou en R et/ou en javascript.
Vous travaillerez de manière autonome et en étroite collaboration avec les data scientist pour l'intégration de connaissances à priori dans les modèles prédictifs.

Quelles sont mes compétences ?
Vous avez un background Bac+5/+8 en Bio-informatique ou en modélisation de systèmes complexes ; des connaissances en oncologie constitueraient une caractéristique remarquable.
Vous possédez une excellente maitrise des outils de représentation des connaissances, ainsi des bases de connaissances biologiques et des outils statistiques, et évoluez à votre aise en environnement PostgreSQL.

Mots-clés : data integration - Biological network- systems biology - Mixomics - Lasso - IPFLasso - BLasso - PriorityLasso - RGCCA - WGCNA

Vous êtes en phase avec le projet ? vous avez les compétences ? Alors, franchissez le pas, et communiquez-nous votre ambition et votre envie de nous rejoindre !!!

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente