Ingénieur en bioinformatique: ARN non-codants et régulation génique

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat renouvelable
Détails de renouvellement
CDD pour un an renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Adresse

141 rue de la Cardonille
34396 Montpellier 5
France

Contacts
Martine Simonelig
Email du/des contacts
Martine.Simonelig@igh.cnrs.fr
Description

Offre de CDD pour un Ingénieur bioinformaticien en traitement de données NGS

Un poste d'ingénieur bioinformaticien/biostatisticien est disponible pour un an, renouvelable, dans l'équipe "Régulation des ARNm et Développement" à l'Institut de Génétique Humaine, Montpellier. L'ingénieur travaillera en étroite collaboration avec les chercheurs de l'équipe. Le projet porte sur la régulation des ARNm par des petits ARNs non-codants piRNAs (Piwi-interacting RNAs). Les données à analyser proviennent de NGS (RNA-seq, small RNA-seq) et de spectrométrie de masse. L'ingénieur devra s'impliquer dans le projet pour comprendre les questions biologiques et développer les outils bioinformatiques nécessaires.
(Barckmann et al. Cell Reports 2015, 12, 1205-16; Rojas-Rios et al. EMBO Journal 2017, 36, 3194-3211; Dufourt et al. Nature Communications 2017, 8, 1305).

Les compétences suivantes sont requises:
- expérience dans la gestion et la manipulation de données biologiques à grande échelle
- expérience dans l'utilisation d'outils bioinformatiques et biostatistiques existants pour
l'analyse de données en génomique et transcriptomique (R, Bioconductor, …)
- Compétences en programmation (Perl, Python, R...)
- Maîtrise des systèmes d’exploitation Windows et Linux
- Adapter les applications informatiques aux besoins du projet
- Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats
- Assurer la transition entre données biologiques et données bioinformatiques
- Travailler de façon indépendante et communiquer avec l'équipe de biologistes

Niveau requis: Master ou Ingénieur/Thèse

Date de début du contrat: Juin/juillet 2019

Institut de Génétique Humaine: https://www.igh.cnrs.fr/fr/
Contact: Martine Simonelig, Martine.Simonelig@igh.cnrs.fr
https://www.igh.cnrs.fr/fr/recherche/departements/genetique-et-developp…

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente