R&D en Bioinformatique - développement séquençage 2e et 3e génération / design et maintenance pipelines / administration et optimisation du cluster de calcul

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

8 avenue Rockefeller
69008 Lyon
France

Contacts
Abdelghafar GOUMAIDI
Email du/des contacts
abdel.goumaidi@viroscan3d.com
Description

ViroScan3D recrute un(e) : Jeune Docteur R&D en Bioinformatique

 
 

La société

La société ViroScan3D est une société de biotechnologie créée en 2012, localisée à la Faculté de Médecine et de Pharmacie Rockefeller (Lyon 8ème). Sa mission est de réaliser des prestations personnalisées de génomique (principalement de NGS), depuis le traitement des échantillons biologiques jusqu’à l’analyse de données bioinformatiques. La société compte une dizaine de personnes et travaille pour des clients académiques et industriels. De plus, ViroScan3D travaille en étroite collaboration avec ProfileXpert, une plateforme académique de génomique.
 

Environnement de travail

La personne recrutée renforcera l’équipe d’analystes composée actuellement de 3 ingénieurs bioinformaticiens. Elle travaillera sur un cluster de calcul sous Linux et collaborera régulièrement avec les biologistes.
 

Mission

La principale mission du poste est de mener à bien des projets de développement en bioinformatique axés sur des techniques de séquençage de deuxième et troisième génération. Le candidat prendra part à l’ensemble des étapes de développement des projets : de leurs conceptions stratégique à leurs finalisations.
Le candidat prendra également part au design et à la maintenance de différents pipelines bioinformatiques (analyse de séquences) ainsi qu’à l’administration et à l’optimisation du cluster de calcul (systèmes et réseaux).
 

Profil

        - PhD en Bioinformatique
        - Expérience pratique d’analyse de données issues d’HTS (High-Throughput Sequencing)
        - Maitrise d’au moins un langage de programmation de haut niveau
       - Expérience de travail sous un environnement Linux/HPC (scripts shell, scheduler, …)
        - Solides connaissances en biostatistiques
        - Forte capacité d’autonomie, de travail en groupe et d’initiative permettant une gestion complète des projets
        - Des connaissances en ingénierie logicielle constitueraient un réel avantage
 

Contrat

        - CDI
        - Poste à pourvoir dès Janvier 2019
        - Salaire en fonction du profil
 

Candidature

     Envoyer CV & lettre de motivation à Abdelghafar GOUMAIDI :
              abdel.goumaidi@viroscan3d.com

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente