Ingénieur bioinformaticien(ne) responsable cellule bioinformatique

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

1 avenue Joliot Curie
31059 Toulouse 9
France

Contacts
Manon Cassou (Responsable cellule bioinformatique)
Denis Jeannelle (DSIO)
Christine Toulas (Responsable du laboratoire d'oncogénétique)
Email du/des contacts
cassou.manon@iuct-oncopole.fr
jeannelle.denis@iuct-oncopole.fr
toulas.christine@iuct-oncopole.fr
Description

Ingénieur Bioinformaticien
Informations sur le poste
Date de parution :17/12/2019
Lieu : Toulouse
Prise de poste : Selon disponibilité
Type de contrat : CDI
Temps de travail : Temps plein
Niveau d’études : Bac +5
Niveau d’expérience : 2 ans

• L’établissement :
Etablissement privé d’intérêt collectif, l'Institut Claudius Regaud (ICR) est le Centre de Lutte Contre le Cancer (CLCC) de Midi-Pyrénées. Il fait partie du groupe UNICANCER, qui réunit les 18 CLCC français et leur fédération qui consacrent entièrement leur activité à la cancérologie. Le soin, la recherche et l'enseignement en cancérologie sont les missions majeures de l'ICR, qui regroupe un effectif de 950 personnes dont 80 médecins et chercheurs. L’ICR est certifié depuis 2017 sans recommandation ni réserve par la Haute Autorité de Santé dans le cadre de la procédure d’évaluation V2014. En 2014 l’ICR a intégré l’Institut Universitaire du Cancer, hôpital de l’Oncopole de Toulouse (IUCT-O), avec des services de cancérologie du CHU de Toulouse (www.iuct-oncopole.fr).

Coordonnées du recruteur :
Institut Claudius Regaud
IUCT – Oncopole
1 avenue Irène Joliot-Curie
31059 Toulouse Cedex 9
Référence offre :
2019-12-73
Merci de postuler sur le site : www.claudiusregaud.fr/Le-recrutement/Offres-d-emploi

• Le poste :

Contexte :
L'Institut Claudius Regaud IUCT-ONCOPOLE, Centre de Lutte Contre le Cancer, recherche un responsable pour la cellule bioinformatique de l'IUCT-Oncopole. La cellule de bioinformatique a pour objectif de proposer une expertise et des outils afin d'accompagner les équipes médicales principalement dans le diagnostic des patients et pour leurs projets de recherche. L'équipe de 8 bioinformaticiens travaille principalement sur la comparaison, l'analyse, la diffusion et la sauvegarde des données issues de séquençage haut débit (NGS). Le poste est rattaché à la Direction du Système d'Information et au laboratoire.

Missions :
Le responsable Bioinformatique :
- assurera la gestion des moyens humains et matériels de la cellule de bio-informatique ;
- définira les choix technologiques, la mise au point et la validation scientifique des solutions d'analyse des données de séquençage à visée diagnostique ;
- organisera et participera à la formation et au support des utilisateurs dans l'application et la compréhension des méthodes d'analyses ;
- veillera au respect des normes qualité régissant le fonctionnement des laboratoires ;
- réalisera la veille scientifique ;
- participera à la conception et au suivi des projets de développement des logiciels conduits par la plateforme ;
- participera au montage, au suivi et à la valorisation des projets de recherche portés par l'IUCT concernant le NGS et la bioinformatique ;
- assurera une activité ponctuelle d'enseignement dans des modules universitaires et dans l'encadrement d'étudiants.

Profil recherché :
Niveau bac+5 en bio-informatique (Master bioinformatique,
Master analyse et modélisation des données, Master Sciences du
vivant spécialité bioinformatique, Master Biotechnologie et
informatique, école d'ingénieur en biotechnologie spécialité
bioinformatique).
Expérience de management d'équipe d'au moins 2 ans.
De préférence, expérience au sein d'une structure utilisant le NGS à
visée sanitaire dans des laboratoires accrédités ou en cours
d'accréditation.

Savoir-faire requis :
• Management d’équipe.
• Conduite de projet informatique : posséder de bonnes pratiques de
méthodes de développement informatique (méthodes agiles,
modélisation, gestion de version via Git, tests unitaires, fonctionnels
et applicatifs…).
• Programmation : maîtriser les langages de programmation : Java,
Python.
• Bioinformatique : maîtrise des logiciels et pipelines d’analyse de
données de NGS (recherche de SNV, CNV).
• Rechercher, sélectionner, exploiter et capitaliser les informations
liées à la veille dans son domaine d'activité.

Serait un plus :
• Programmation dans différents environnements informatiques en
particulier sur une structure de type HPC.
• Connaissance des environnements virtuels (VM et Singularity).
• Connaissance de Snakemake.

Aptitudes :
• Excellentes qualités relationnelles, d'écoute et de communication.
• Capacité à manager une équipe.
• Grande autonomie et capacité organisationnelle.
• Travail en équipe avec des facilités à transmettre ses
connaissances à d’autres métiers.

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente