Big Data Manager

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

25 Rue du Docteur Roux
75724 Paris 15
France

Contacts
Etienne Patin
Email du/des contacts
milieuinterieur@pasteur.fr
Description

Le projet Milieu Intérieur (http://www.milieuinterieur.fr/fr) est une étude de cohorte ambitieuse
visant à analyser l'impact de la génétique et de l'environnement, ainsi que leurs interactions, sur le
système immunitaire. Les objectifs sont d'établir une compréhension approfondie de la variation
immunitaire dans la population générale, et de déterminer le rôle de la génétique, du vieillissement,
de la consommation de tabac, ou du microbiote dans la régulation des programmes immunitaires. Le
big data manager traitera de grands ensembles de données biologiques (génomes humains, ARN-seq
transcriptomes, microbiomes, protéomes, etc.), gérera le cycle de vie complet des données et
développera des bases de données en ligne et hors ligne facilitant les demandes d'accès régulières
aux données.
Dans le cadre de ce projet, vous serez en charge de :
- la gestion de multiples données “omics” générées par le Consortium Milieu Intérieur, en
collaboration avec les coordonnateurs et bioinformaticiens du Consortium
- le dépôt de l’ensemble des données “omics” dans les dépôts publics
- la préparation des jeux de données répondant aux demandes approuvées d’accès aux
données
- la création de grandes bases de données de résultats du Milieu Intérieur, afin de favoriser la
reproductibilité et l’ouverture de la science
Nous recherchons un.e candidat.e qui aime coder, structurer, organiser des gros volumes de
données type Big Data. Les connaissances en génétique ou en biologie seraient un plus.
Compétences requises :
- Diplôme : niveau Master en bio-informatique
- Expérience : 3 à 5 ans idéalement
- Maîtrise de l'anglais, niveau B2
- Maîtrise des langages de programmation (R, SQL, Python, Unix shell…), expérience en HPC
(Calcul à Haute Performance) obligatoire
- Compétence dans le traitement de grands ensembles de données
- Grande capacité à travailler en équipe et à centraliser l’information (milieu très collaboratif)
- Bonne communication avec les membres de l’équipe

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente