Société Française de Bio-Informatique

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 2006

Développements théoriques et méthodes numériques pour les analyses comparatives de génomes et protéomes biaisés. Application a la comparaison des génomes et protéomes de Plasmodium falciparum et d’Arabidopsis thaliana Olivier Bastien Université Joseph Fourier, Grenoble
Style du génome exploré par analyse textuelle de l’ADN Sylvain Lespinats Université Paris 6, École doctorale Santé Public : Épidémiologie et Sciences de l’Information Biomédicale
Le transcriptome : un domaine d’application pour les statistiques, de nouveaux horizons pour la biologie Anne-Sophie Carpentier Université d’Évry, École doctorale Des Génomes aux Organismes
Algorithmes pour la prédiction de structures secondaires des ARN Stefan Engelen Université d’Evry, Ecole Doctorale Des Génomes aux Organismes
Conception d’un modèle Web sémantique appliqué à la génomique fonctionnelle Fleur Mougin Université de Rennes 1, Ecole doctorale Vie, Agro, Santé
Les peptides d’encrage à l’interface membranaire : analyses structurales par RMN et dynamique moléculaire et développement d’une méthode de prédiction bioinformatique Nicolas Sapay Université Lyon 1, Ecole Doctorale Interdisciplinaire Sciences-Santé
De l’analyse de données d’expression à la reconstruction de réseaux de gènes Marie Agier Université Clermont-Ferrand 2
Reconnaissance protéine-protéine : Modélisation d’effets electrostatiques et de solvatation Nicolas Calimet Universités Paris 6 et Paris 7, École Doctorale de Biochimie et Biologie Moléculaire
Méthodes de distance pour l’inférence phylogénomique Alexis Criscuolo Université de Montpellier 2
Algorithmes pour l’analyse de régions régulatrices dans le génome d’eucaryotes supérieurs Matthieu Defrance Université des Sciences et Technologies de Lille, Ecole doctorale d’Informatique
Etude de la distance de transfert entre partitions et recherche de zones denses dans un graphe Lucile Denoeud Université Paris 1
Un cadre formel pour l’annotation experte des gènes eucaryotes Sarah Djebali École Normale Supérieure et Université d’Evry
Utilisation de la tessellation de Voronoï pour la modélisation des complexes protéine-protéine Julie Bernauer Université Paris Sud
Exploration des caractéristiques tridimensionnelles des amas protéiques hydrophobes issus du formalisme "Hydrophobic Cluster Analysis" (HCA). Modélisation de formes oligomériques solubles du peptide Abeta impliqué dans la maladie d’Alzheimer, et identification d’un "point chaud" commun à différentes protéines amyloïdes Fabienne Dulin Université Paris 6, École doctorale Inter///Bio
Développements méthodologiques relatifs à l’attribution et à la prédiction des structures secondaires des protéines globulaires. Classification structurale de mutations du transporteur CFTR, observées chez des patients atteints de mucoviscidose Richard Eudes Université Paris 6, Ecole doctorale Interfaces de la Chimie, de la Physique et de l’Informatique avec la Biologie
Etude et conception d’une plate-forme d’intégration et de visualisation de données génomiques et d’outils bioinformatiques Pierre-Emmanuel Gros Université Paris Sud
In silico drug discovery services in computing grid environments against neglected and emerging deseases Nicolas Jacq Université Clermont-Ferrand 2
La séquence du génome de Tetraodon nigroviridis comme outil dans l’inventaire des gènes humains et dans l’analyse de l’évolution des chromosomes de vertébrés Olivier Jaillon Université d’Evry
Structuration des génomes par sélection indirecte de la variabilité mutationnelle : Une approche de modélisation et de simulation Carole Knibbe Institut National des Sciences Appliquées de Lyon, École doctorale Évolution, Ecosystèmes, Microbiologie et Modélisation
Fonctions noyaux pour molécules et leur application au criblage virtuel par machines à vecteur support Pierre Mahé École des Mines de Paris
Application de l’apprentissage à l’extraction de connaissances à partir de notices bibliographiques en génomique Alain-Pierre Manine Université Paris Sud
Développement d’une plateforme bioinformatique d’outils pour la modéli !sation des structures et pour le criblage virtuel comparatif. Une application sur la protéine kinase FAK Laétitia Martin Université Montpellier 2
Réduction de la dimension et sélection de modèles en classification supervisée Tristan Mary-Huard Université Paris Sud
Développement d’outils pour l’aide à l’identification dans de grandes banques de familles de gènes Anne-Muriel Arigon Université Lyon 1, Ecole doctorale Évolution, Écosystèmes, Microbiologie et Modélisation
Genetic regulatory networks and allelic exclusion : discrete-time piecewise-linear models Arnaud Meyroneine Université d’Aix-Marseille 2, École doctorale Physique et Sciences de la Matière
Le domaine protéique, une unité d’homologie pertinente en génomique comparative Sophie Pasek Université d’Evry
Filtrage de séquences d’ADN pour la recherche de longues répétitions multiples Pierre Peterlongo Université de Marne-la-Vallée
Modélisation de séquences génomiques, génération aléatoire et applications Yann Ponty Université Paris Sud
Modèle formel pour les réseaux de régulation génétique et influence des circuits de rétroaction Adrien Richard Université d’Evry
Évolution et prédiction des activités des glycoside hydrolases Mark Stam Université d’Aix-Marseille 1 & 2, École doctorale Bioinformatique, Biochimie Structurale et Génomique
Fly Genome Explorer : a versatile tool for the exploration and the exploitation of structural and functional annotations related to Drosophila melanogaster genes ; Application to a Drosophila model for the study of hypertrophic cardiomyopathies. Thien-Phong Vu Manh Université d’Aix-Marseille 2, Ecole Doctorale des Sciences de la Vie et de la Santé
Validation de modèles qualitatifs de réseaux de régulation génique : une méthode basée sur des techniques de vérification formelle Grégory Batt Université Joseph Fourier
Evolution du chromosome linéaire des Streptomyces : transfert horizontal et variabilité des extrémités chromosomiques Frédéric Choulet Université Nancy 1
Approches phylogénétiques et bioinformatiques pour l’analyse de la coévolution à l’échelle moléculaire Julien Dutheil Université Montpellier 2, Ecole Doctorale : Biologie des Systèmes Intégrés, Agronomie – Environnement
Modélisation et analyse logique d’un réseau de régulation impliqué dans la mise en place d’une frontière développementale Aitor Gonzalez Université d’Aix-Marseille 2
Méthodes informatiques pour l’expérimentation in virtuo de la cinétique biochimique : application à la coagulation du sang Sébastien Kerdélo Université de Rennes 1, École doctorale Matisse
Ordonnancement et réplication de données bioinformatiques dans un contexte de grille de calcul Antoine Vernois Ecole Normale Supérieure de Lyon, Ecole doctorale de Mathématique - Informatique
Représentation digitale du développement embryonnaire : Le système NISEED et ses applications dans l’étude des ascidies Olivier Tassy Université d’Aix-Marseille 2, École doctorale Bioinformatique, Biologie Structurale et Génomique
Exploration immersive de données génomiques textuelles et factuelles : vers une approche par « Visual Mining » Nicolas Ferey Université Paris Sud