CDD Ingénieur

équivalent IE

Bioinformaticien en analyse de données NGS

Fiche de poste : Bio-informaticien
Contexte :
Les techniques de séquençage à haut-débit ont permis d’accroître considérablement nos connaissances en génomique, transcriptomique et épigénétique. Toutes ces applications nécessitent la mise en place de chaînes de traitement bioinformatiques dédiées, permettant d'analyser et d'extraire l'information biologique pour répondre à la question posée.
Le Pôle Biopathologie du Centre Hospitalier Régional d'Orléans regroupe les services de Génétique, Pathologie (anatomie et cytologie pathologiques) et Biologie Médicale.

Gestion des premières étapes d’analyses de génomes entiers

Bonjour,
Dans le cadre d’un projet ANR JCJC sur l’adaptation parallèle des champignons au fromage, nous recrutons un-e ingénieur-e d’étude en bioinformatique (niveau Master, bac+5) au sein du laboratoire Ecologie Systématique et Evolution de l’université Paris-Saclay à Orsay (équipe Génétique et écologie évolutives). L’ingénieur-e aura pour mission de gérer les premières étapes d’analyses de génomes entiers :

Big Data Manager

Le projet Milieu Intérieur (http://www.milieuinterieur.fr/fr) est une étude de cohorte ambitieuse
visant à analyser l'impact de la génétique et de l'environnement, ainsi que leurs interactions, sur le
système immunitaire. Les objectifs sont d'établir une compréhension approfondie de la variation
immunitaire dans la population générale, et de déterminer le rôle de la génétique, du vieillissement,
de la consommation de tabac, ou du microbiote dans la régulation des programmes immunitaires. Le

Bioinformatics/biostatistics (M/F)

The Saclay Plant Sciences network (SPS, www.saclayplantsciences.fr) gathers around 50 research teams specialized in plant sciences belonging to 5 institutes in the Saclay area (south west of Paris) and represents almost 700 people. The current research activities of the SPS partners concern the genetic, molecular and cellular mechanisms that control plant physiology and development, as well as their interactions with fluctuating biotic or abiotic environments.

Bioinformatics Developer

Description

We are looking for a bioinformatics engineer to join a team developing tools for the analysis of data from a human metagenomic clinical project. This is a CDD position for 24 months in the group of Sean Kennedy in the Department of Computation Biology, CNRS USR 3756, Institut Pasteur, Paris.

The successful candidate will work in close collaboration with the other developer on the project and with the head of the team. He or she will also have the opportunity to participate in other metagenomics projects in the group.

Développement d'un Intermine autour de l'expression des éléments transposables de plantes

Environnement
L'activité s'exercera à l'URGI (http://urgi.versailles.inra.fr/), Unité de Recherche en Génomique-Info (21 bioinformaticiens dont 16 permanents INRAE) dédiée à la génomique et à la génétique des plantes et de ses bio-agresseurs. Son activité de recherche porte sur la structure et la dynamique des génomes. L’unité héberge une plate-forme bioinformatique appartenant au réseau IFB (Institut Français de Bioinformatique).

Ingénieur.e de recherche bioinformatique - Groupe dry-lab de la plateforme technologique Biomics

Le poste à pourvoir est un poste de bioinformaticien au sein du Hub de bioinformatique et biostatistique de l'Institut Pasteur. Le candidat retenu sera détaché à 80% sur la plateforme Biomics (séquençage) pour renforcer le groupe existant de bioinformaticiens.

Vos tâches principales comprendront notamment (1) la gestion (analyse) de projets NGS (recherche de variants, assemblages génomiques, analyse différentielle, etc.) et le développement d'outils logiciels essentiellement à l'aide du langage Python.

Engineer Bioinformatics

In the Innate Pharma Research Laboratories, reporting to the Manager of the Bioinformatics platform, you will be a core team member within a matrix organization. You will be actively involved in the bioinformatics activities from early stages of development to translational studies of clinical trials. The expanding bioinformatics team focuses on achieving the full potential of immunotherapy. By analyzing and integrating large omics data, you will address the challenges of target discovery, drug combination strategy, patient stratification and drug response prediction.