Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes - Laboratoire de Biochimie et Biologie Moléculaire

Bioinformatique en pharmacogénétique hospitalière

Titre du stage :
Développement d’une application d’aide à la prescription d’analgésiques opioïdes à partir de données issues de NGS.

Orientation scientifique du sujet du stage : Pharmacogénomique, NGS, outil d’aide à la décision thérapeutique, douleur.

Méthodes informatiques utilisées et outils utilisés : programmation JAVA, Python, R et autres langages de programmation ; utilisation d’API, HTML.
Alignement de séquence sur génome de référence, recherche de variants rares, prédiction de pathogénicité sur variants inconnus.