Master

Rôle de la marque d’histone H3K9me3 dans le contrôle des éléments transposable au cours de la différenciation des cellules du système immunitaire

Résumé du projet de stage:
Le système immunitaire est une machinerie complexe qui protège efficacement l’organisme contre un large panel de dangers comme les toxines, les virus, les bactéries ou les parasites. Il est composé de populations cellulaires phénotypiquement et fonctionnellement distinctes qui se coordonnent dans le temps et dans l’espace pour maintenir l’intégrité de l’organisme face aux différents types de dangers.

Pipeline de détection de variants structuraux

Contexte

Les variants structuraux (SV pour « Structural Variants ») désignent des remaniements dans l’organisation du génome pouvant concerner plusieurs millions de paires de nucléotides. Deux catégories d’événements peuvent être distingués : (i) les variants équilibrés tels que les translocations ou les inversions ; (ii) les variants affectant le nombre de copies, que sont les délétions et duplications (CNV, pour Copy Number Variants).

Computational biologist in charge of PacBio sequencing data

The Institut Curie is a major player in the research and fight against cancer. It consists of a hospital and a Research Center of more than 1000 employees with a strong international representativeness. The objective of the Curie Institute Research Center is to develop basic research and to use the knowledge produced to improve the diagnosis, prognosis, and therapeutics of cancers as part of the continuum between basic research and innovation serving the patient.

Main missions of the position :

M2 - Amélioration et optimisation d'une librairie JavaScript pour la visualisation de réseaux métaboliques

CONTEXTE DU STAGE
La reconstruction des réseaux métaboliques a pour objectif de regrouper l'ensemble des réactions métaboliques pouvant avoir lieu dans une cellule ou un tissu. Ces réseaux peuvent contenir des milliers de réactions et de métabolites. La manipulation interactive du réseau ou de sous-parties de ce réseau permet une analyse visuelle intuitive de la structure du réseau mais également l'analyse globale de données omiques sur les métabolites ou les réactions. Il est donc important de proposer une visualisation intuitive et réactive de ces réseaux de grandes tailles.