URGI

Automatisation et généralisation d‘intégration de données issues de fouille de texte dans un système d’information

Mots clés

  • Pipelines et containerisation : Python, Nextflow, VRE, Docker, GNU/Linux, Shell
  • Interfaces et visualisation : Java, Elasticsearch, Web services REST, Spring Boot,
    Javascript, Angular

Description

Contexte

Un des enjeux de la biologie végétale est d’étudier, voire de prédire, le phénotype d’une plante
et sa capacité à s’adapter à des stress à partir de données génétiques, génomiques et
environnementales. Ce lien entre génotype et phénotype s’effectue via des approches de

Ingénieur dévelopement d'application web (Java RDF, NoSQL)

L’URGI, unité INRA de recherches en génomique info (33 bioinformaticiens dont 17 permanents INRA) dédiée à la génomique et à la génétique des plantes et de ses bioagresseurs recherche un ingénieur en développement d’applications web, en contrat CDD

Durée : 10 mois renouvelables

 

Lieu de travail:

INRA-URGI (http://urgi.versailles.inra.fr) sur le centre INRA de Versailles (http://www.versailles.inra.fr).

 

Mission :

URGI

Acronyme ou nom de la structure
Nom complet (en toutes lettres)
Unité de recherche en Génomique-Info
Adresse

Unité de Recherches en Génomique-Info (UR INRA 1164),
INRA, Centre de recherche de Versailles, bat.18
RD10, Route de Saint Cyr

78026 Versailles Cedex, FRANCE
France

Téléphone
+33 1 30 83 30 00
Description (English)

URGI - Unité de Recherche Génomique Info - is a research unit in genomics and bioinformatics at Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), dedicated to plants and crop parasites. The URGI research activity covers data integration as well as genome structure and dynamics. URGI hosts a bioinformatics platform which belongs to the Institut Français de Bioinformatique, the French node of Elixir, the European network of bioinformatics platforms.

SFBI
Membre de la SFBI

Ingénieur en développement systèmes d'informations

L’URGI, unité INRA de recherches en génomique info (33 bioinformaticiens dont 22 permanents INRA) dédiée à la génomique et à la génétique des plantes et de ses bioagresseurs recherche :

1 ingénieur en développement d’applications, en contrat CDD

 

Durée : 20 mois

 

Lieu de travail:

INRA-URGI (http://urgi.versailles.inra.fr) sur le centre INRA de Versailles (http://www.versailles.inra.fr).

 

Mission :