Thèses et Habilitation à Diriger des Recherches

Nom Prénom Année Diplôme Title Université
NicolasThierry-Mieg 2013 Thèse Smart-pooling et interactomes Université de Grenoble
Ahmed 2009 Thèse Identification et Analyse des Signaux de Codes Circulaires dans les Gènes par des Méthodes Bioinformatiques Université de Strasbourg
Nguyen 2007 Thèse Relations structure-fonction dans la superfamille des Cytochromes P450. Études bioinformatiques Université Denis Diderot (Paris 7) - Ecole doctorale Interfaces de la chimie, de la physique et de l’informatique avec la biologie
PFARR Abibatou MBODJ 2012 Thèse Modelisation logique de la differentiation du mesoderme chez Drosophila melanogaster Université d'Aix-Marseille
SMITH Adam Alexander Thil 2012 Thèse Exploitation automatisée de contextes métaboliques et génomiques comme aide à l'annotation fonctionnelle de génomes prokaryotes Des Genomes aux Organismes, Université Evry Val d'Essonne
Rougny Adrien 2016 Thèse Méthodes qualitatives pour la construction et l'analyse de réseaux moléculaires SBGN Université Paris-sud
Candat Adrien 2012 Thèse Analyse de la localisation subcellulaire des protéines LEA (late embryogenesis abundant) chez Arabidopsis thaliana par des approches de bioinformatique et de biologie cellulaire École doctorale Végétal Environnement Nutrition Agroalimentaire Mer, Université d'Angers
Melquion Adrien 2007 Thèse Agrégation de peptides amyloïdes par des simulations numériques Université Paris 7 - Denis Diderot - Ecole doctorale Biochimie et Biologie Moléculaire
Richard Adrien 2006 Thèse Modèle formel pour les réseaux de régulation génétique et influence des circuits de rétroaction Université d’Evry
Basso-Blandin Adrien 2014 Thèse Conception d’un langage dédié à la conception de fonctions biologiques de synthèse par compilation de spécifications comportementales Univ. Evry Val d'Essonne
Fauré Adrien 2009 Thèse Modélisation logique du réseau de régulation contrôlant le cycle cellulaire chez les eucaryotes Universtité de la Méditerranée, Università degli Studi di Torino
Coulet Adrien 2008 Thèse Construction et utilisation d'une base de connaissances pharmacogénomique pour l'intégration de données et la découverte de connaissances. Université de Nancy
Gonzalez Aitor 2006 Thèse Modélisation et analyse logique d’un réseau de régulation impliqué dans la mise en place d’une frontière développementale Université d’Aix-Marseille 2
Manine Alain-Pierre 2006 Thèse Application de l’apprentissage à l’extraction de connaissances à partir de notices bibliographiques en génomique Université Paris Sud
Tek Alex 2012 Thèse Visualisation et simulations numériques avancées en biologie - Applications au complexe SNARE impliqué dans la fusion membranaire Univ. Paris 6
Calteau Alexandra 2005 Thèse Relations évolutives entre les bactéries et les archées hyperthermophiles Université Claude Bernard - Lyon 1, École Doctorale : Évolution, Écosystèmes, Microbiologie et Modélisation
Gillet Alexandre 2007 Thèse Tangible interface for molecular modeling Université Denis Diderot
Lamiable Alexis 2011 Thèse Méthodes de théorie des jeux pour la prédiction de la structure 3D de l'ARN Université Paris XI
Criscuolo Alexis 2006 Thèse Méthodes de distance pour l’inférence phylogénomique Université de Montpellier 2
Héliou Alice 2017 Thèse Analyse des séquences génomiques : Identification des ARNs circulaires et calcul de l'information négative
Cleynen Alice 2013 Thèse Approches statistiques en segmentation : application à la ré-annotation de génome AgroParisTech
Cartier-Michaud Amandine 2010 Thèse Étude de l'influence du PAI-1 matriciel sur la régulation de la transition Mésenchymo-Amiboïde des cellules cancéreuses Université d’Evry
Héliou Amélie 2017 Thèse Conformations moléculaire et théorie des jeux
Ghozlane Amine 2012 Thèse Développement de méthodes bioinformatiques dédiées à la prédiction et l'analyse des réseaux métaboliques et des ARNs non-codants Université de Bordeaux I
Kozomara Ana 2009 Thèse Détection des ARN non-codant dans les séquences génomiques. Application au génome de Ralstonia solanacearum INRA Toulouse
Necsulea Anamaria 2008 Thèse Etude des patrons d'évolution asymétrique dans les séquences d'ADN Université Claude Bernard - Lyon 1
Yartseva-Smidtas Anastasia 2007 Thèse Modélisation incrémentale des réseaux biologiques Université d’Evry
RAU Andrea 2017 HDR Statistical methods and software for the analysis of transcriptomic data Université d’Evry-Val-d’Essonne
Aravena Andrés 2013 Thèse Probabilistic and constraint based modelling to determine regulation events from heterogeneous biological data Univ. Rennes 1 & Univ. Santiago du Chili
BESSADOK Anis 2011 Thèse La multi-spécificité de transport de la P-glycoprotéine: études de modélisation comparative et de docking au sein de la famille des protéines ABC CEA Saclay
Ghoorah Anisah 2012 Thèse Extraction de Connaissances pour la Modélisation tri-dimensionnelle de l'Interactome Structural Université de NAncy, INRIA
ZHUKOVA Anna 2014 Thèse Knowledge-based generalisation for metabolic models Université de Bordeaux
Fiston-Lavier Anna-Sophie 2008 Thèse Etude de la dynamique des répétitions dans les génomes eucaryotes : de leur formation à leur élimination Ecole Doctorale Logique du vivant, Université Pierre et Marie Curie (Paris 6)
Crumière Anne 2008 Thèse Circuits de rétroaction dans les réseaux génétiques de régulation intercellulaires Ecole doctorale de Mathématiques et Informatique, Université de la Méditerranée
Gaillard Anne-Laure 2011 Thèse Identification de motifs au sein des structures biologiques arborescentes Université de Bordeaux I
Abraham Anne-Laure 2008 Thèse Caractérisation et analyse évolutive des répétitions intragéniques : une étude au niveau des gènes, des séquences protéiques et des structures tridimensionnelles
Arigon Anne-Muriel 2006 Thèse Développement d’outils pour l’aide à l’identification dans de grandes banques de familles de gènes Université Lyon 1, Ecole doctorale Évolution, Écosystèmes, Microbiologie et Modélisation
Carvunis Anne-Ruxandra 2011 Thèse Des proteines et de leurs interactions aux principes évolutifs des systèmes biologiques Université de Grenoble, Faculté de Médecine-Pharmacie
Carpentier Anne-Sophie 2006 Thèse Le transcriptome : un domaine d’application pour les statistiques, de nouveaux horizons pour la biologie Université d’Évry, École doctorale Des Génomes aux Organismes
Sertier Anne-Sophie 2011 Thèse L'évolution modulaire des protéines : un point de vue phylogénétique Université Claude Bernard (Lyon I)
Thévenin Annelyse 2009 Thèse Aspects Algorithmiques des Réarrangements Génomiques : Duplications et Ordres Partiels Université Paris-Sud, Orsay
Chateau Annie 2016 HDR Des ordres et désordres ou comment bien réarranger son génome Université Montpellier
Labarre Anthony 2008 Thèse Aspects combinatoires des réarrangements génomiques et des réseaux d'haplotypes
Mathelier Anthony 2010 Thèse Analyse de signaux dans les séquences génomiques: Recherche de microARN chez les eucaryotes. Étude de la distribution des gènes chez Escherichia coli Université Pierre et Marie Curie (Paris VI)
Vernois Antoine 2006 Thèse Ordonnancement et réplication de données bioinformatiques dans un contexte de grille de calcul Ecole Normale Supérieure de Lyon, Ecole doctorale de Mathématique - Informatique
Coulon Antoine 2010 Thèse Stochasticité de l'expression génique et régulation transcriptionnelle -- Modélisation de la dynamique spatiale et temporelle des structures multiprotéiques INSA de Lyon
Marchais Antonin 2010 Thèse Etude de la co-évolution des éléments codants et non-codants des génomes bactériens Université Paris-sud
Meyroneine Arnaud 2006 Thèse Genetic regulatory networks and allelic exclusion : discrete-time piecewise-linear models Université d’Aix-Marseille 2, École doctorale Physique et Sciences de la Matière
Finkler Audrey 2010 Thèse Modèle d'évolution avec dépendance au contexte et corrections de statistiques d'adéquation en présence de zéros aléatoires Université de Strasbourg
Bornot Aurélie 2009 Thèse Analyse et prédiction de la relation séquence – structure locale et flexibilité au sein des protéines globulaires Université Denis Diderot, Ecole Doctorale B3MI