Ingénieur bioinformaticien IE ou IR

Type de poste: 
Durée du poste: 
6 mois
Ville: 
Bordeaux
Laboratoire: 
Centre de Bioinformatique de Bordeaux - CBiB
Adresse: 

146 Rue Léo Saignat

33076 Bordeaux Cedex

 

Nom et prénom du contact: 
Nikolski Macha
Nom et prénom du contact: 
Groppi Alexis
Email du contact: 
macha [dot] nikolski [at] u-bordeaux [dot] fr
Email du contact: 
alexis [dot] groppi [at] u-bordeaux [dot] fr
Date de validité: 
28/02/2018
Description du poste: 

Le Centre de Bioinformatique de Bordeaux est une équipe de service et de recherche dynamique dans le domaine de la bioinformatique.

Nous recherchons un ingénieur bioinformaticien IE ou IR pour rejoindre notre équipe, d'abord pour une mission de 6 mois extensible d'au moins 1 an.

Missions :

  • Traitement bioinformatique et statistique des données.
  • Développement de bases de données "omics" et de méthodes d'analyse de séquences
  • Conseils méthodologiques et assistance pour l'analyse des données
  • Collaboration avec des chercheurs biologistes pour leur fournir des analyses lors de la préparation d’articles scientifiques ou de demandes de subvention.
  • Veille technologique + développement + entretien des workflows.

Connaissance opérationnelle des techniques de programmation :

  • Maîtrise de la programmation en Python, MySQL (Ingénieur bioinformaticien IE ou IR )
  • Connaissance souhaitée d’outils d'analyse d'expression et de networks tels que GSEA

Connaissances et compétences mobilisées :

  • Expérience réussie en bioinformatique (génomique, transcriptomique, métabolomique etc)
  • Expérience dans le développement de bases de données Connaissance d'outils statistiques les plus utilisées en bioinformatique

Connaissance opérationnelle des techniques de programmation :

Maîtrise de la programmation en Python, MySQL (ou MongoDB etc) Maitrise de Unix/Linux / shell, Perl, Javascript ou autre technologie web Connaissance souhaitée d’outils d'analyse d'expression et de networks tels que GSEA

Activités essentielles :

  • Mettre en place des bases de données "omics" Mettre en place des procédures standardisées de traitement des données
  • Développer de nouveaux outils nécessaires à l’analyse et à l’intégration des données (pipelines, outils statistiques, etc)
  • Mettre en place des interfaces utilisables par les chercheurs pour le transfert, le stockage, le contrôle qualité et l'analyse des données Participer à la rédaction des sections spécialisées des articles
  • Assurer le respect des normes Qualité et des réglementations en vigueur Assurer le support et la formation aux outils développés

Qualités requises :

  • Autonome et rigoureux, avec un sens de l'organisation qui permet de mener des projets impliquant des collaborateur venant de plusieurs disciplines
  • Excellentes qualités relationnelles, d'écoute et de communication
  • Goût pour le travail d'équipe et le partage des connaissances
  • Esprit d'initiative, curiosité, créativité technique
  • Maitrise d'anglais

Formation requise :

Le candidat devra être au moins titulaire d'un BAC+5, en informatique, bioinformatique, biostatistique ou mathématiques appliquées