Recherche de QTL sur les performances de croissance et d’abattage chez le bovin Créole

Type de poste
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

<p>INRA-Unité de Recherches Zootechniques, Domaine Duclos, 97170 Petit-Bourg (Guadeloupe)</p>
Petit-Bourg
France

Contacts
Michel NAVES
Email du/des contacts
michel.naves@inra.fr
Description

Cette étude s’inscrit dans le cadre des travaux en cours sur la caractérisation génétique du bovin Créole et l’analyse de la variabilité génétique de ses aptitudes de production.

Une base de données zootechniques est régulièrement alimentée par des performances enregistrées en troupeaux expérimentaux du Domaine de Gardel, notamment sur les croissances post sevrage et les caractéristiques de carcasse. Au total, près de 700 taurillons ont été suivis dans différents systèmes d’engraissement, à l’auge et au pâturage, pendant près de 30 ans. On dispose ainsi de données de croissance (pesées mensuelles), de caractéristiques d’abattage (mensurations corporelles, pesées des organes, rendement carcasse) et de composition de la carcasse (développement de différents tissus adipeux, dissection de côtes).

Parallèlement, des prises de sang ont été réalisées, depuis près de 20 ans, sur tous les animaux expérimentaux, en vue d’analyses de génotypages, suivant différentes densités de marqueurs (puces HD – 777 K SNP, MD – 54 K SNP, LD – 10 K SNP).

L’objectif de ce stage est de rechercher des marqueurs associés aux performances de croissance et de caractéristiques d’abattages chez le bovin Créole, et éventuellement associés aux performances obtenues dans les 2 systèmes contrastés (auge et pâturage).

Durant le stage, le programme de travail sera le suivant:

  1. Etude bibliographique sur le sujet

  2. Révision de la base de données de performances zootechniques

  3. Analyse des principaux facteurs de variation des performances

  4. Recherche de QTL pour les principales caractéristiques par méthode GWAS

 

Déroulement du stage

  • Le travail durant le stage concernera :

      • La recherche bibliographique sur le sujet (articles scientifiques de revues internationales, rapport de stages, thèses, …)

      • La participation aux chantiers de mesures sur les animaux vivants et sur les carcasses à l’abattoir, sur la série expérimentale en cours.

      • La mise en forme et le traitement des données de base enregistrées dans la base de données.

      • L’analyse statistique

      • L’interprétation et la comparaison des résultats obtenus

      • La rédaction d’un rapport de stage détaillé et argumenté

      • La présentation orale des travaux de stage devant l’équipe de l’Unité

  • durée souhaitée : 4 à 6 mois de stage

Compétences requises

  • niveau de formation : Ecole Ingénieur en Agriculture, Master

  • disciplines : Biologie, Sciences Animales

  • qualités humaines : bonne capacité de travail en équipe; grande autonomie pour la réalisation des traitements statistiques, la recherche bibliographique ; bonne compréhension de l’anglais écrit

  • notion de biologie moléculaire et d’analyses statistiques

Conditions d’accueil

  • Logement possible aux environs du Centre INRA Antilles-Guyane (Domaine Duclos, Petit-Bourg).

  • Accès au restaurant d’entreprise au tarif de 2,80 €/ repas.

  • Indemnité de stage : 554 €/mois

Référence bibliographique

A. Agastin, M. Naves, G. Alexandre, A. Farant, X. Godard, B. Bocage and M. Boval, 2013.

Effects of feeding system and slaughter age on the growth and carcass characteristics of tropical-breed steers. J. Anim. Sci., 91: 3997-4006