Mots-Clés

Omics Data integration methylome

Description

Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 268 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli-e au sein de l’équipe d’Ecophysiologie des Légumineuses (EcoLeg) de l’UMR Agroécologie de l’INRAE de Dijon. Vous contribuerez à tester différents outils et méthodes informatiques permettant l’intégration et la visualisation de données multi-omiques (transcriptomique, métabolomique) issues d’échantillons de racines et de nodosités de pois soumis à différentes conditions expérimentales, et obtenus dans le cadre du projet FUI Eauptic.

Vous contribuerez également au développement d’un pipeline d’analyse du méthylome.

Vous travaillerez en interaction avec les biologistes et le bio-informaticien du pôle Geapsi (Déterminismes Génétiques et Environnementaux de l’Adaptation des Plantes à des Systèmes de culture Innovants) au sein de l’UMR Agroécologie.

Connaissances souhaitées : Biologie végétale / Biostatistiques / Bioinformatique / Python / R

Expérience : Débutant-e accepté-e, expérience souhaitée en analyses RNAseq

Aptitudes recherchées : Rigueur, sens de l’organisation, bonne aptitude à communiquer