Informaticien – Conception et Développement d’un système d’information en Big Data

 CDD · IR  · 12 mois (renouvelable)    Bac+5 / Master   Centre Léon Bérard · LYON (France)

 Date de prise de poste : 1 octobre 2021

Mots-Clés

data management big data oncologie multi-omiques

Description

Au sein de l'équipe projet et sous la responsabilité d’un data projet manager, vous intervenez sur un périmètre informatique centré sur les données. Vous gardez une vue d’ensemble sur les différents flux de données provenant de plusieurs départements afin de garantir la fiabilité des données et de leur bonne gestion, en d’autres termes vous êtes le/la chef d’orchestre des données du projet en :

1. Contribuant à la conception et au développement d’un système d’information permettant la collecte, stockage, l’usage et le traitement d’un large volume de données (BIG DATA) d’un projet de recherche en oncologie.

➢ Dans la conception :

• Participer au plan de gestion des données ;

• Participer à l'élaboration des documents de suivi du développement : cahier des charges, chronogramme de développement, etc. ;

• Planifier les réunions techniques nécessaires au bon fonctionnement du projet (p.ex. Direction de la recherche clinique et de l'innovation, plateforme bioinformatique, direction des systèmes d'information).

➢ Dans le développement :

• Identifier et rassembler l’ensemble des sources de données structurées nécessaires pour l’appropriation et l’exploitation de la donnée (utilisation des principes FAIR avec le standard OSIRIS) ;

• Garantir la bonne organisation des données du projet (flux des données) ;

• Consolider les informations venant de différentes sources au sein de notre système d’informations (données de suivi temporel des patients) ;

• Construire, maintenir et organiser les données pour rendre leur exploitation optimale et future par des outils de visualisation (p.ex. Dashboard, portail web) ;

• Assurer la sécurité, qualité et l'intégrité des données (cliniques, d’imagerie et omiques); • Analyser et vulgariser les résultats pour les restituer aux cliniciens/chercheurs du projet.

2. Contribuant à l'administration du serveur hébergeant les données :

• Assurer la sauvegarde et la sécurité des données; 


• Installer et mettre à jour des composants logiciels du système d’information


APTITUDES RECHERCHEES

• Bonne compréhension des architectures et environnements techniques (Unix, Docker)

• Maîtriser les outils ETL (p.ex. Apache Spark), langages de requêtes SQL & NoSQL (ElasticSearch)

• Maîtriser les langages de programmation dont au moins un langage de programmation Big Data (Python)

• Bonnes capacités en communication orale et en force de proposition

• Développer avec rigueur et clarté (programmation modulaire)

• Excellentes aptitudes à travailler en autonomie et en transversalité


Candidature

Procédure : Envoyer un email à vincent.letexier@lyon.unicancer.fr

Date limite : 30 octobre 2021

Contacts

Vincent Le Texier

 viNOSPAMncent.letexier@lyon.unicancer.fr

Offre publiée le 16 septembre 2021, affichage jusqu'au 30 octobre 2021