Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

transcriptomiques génomiques bioinformatique voies de biosynthèse métabolistes spécialisés des végétaux bilogie végétale

Description

Le poste de Maître de conférences sera rattaché à l’Equipe BBV, le ou la Maître de conférences sera fortement impliqué dans l’établissement d’une chaîne de valeur complète allant du sourcing à la bioproduction de métabolites végétaux d’intérêt en participant à des projets propres au laboratoire ou collaboratifs avec d’autres partenaires institutionnels ou encore en partenariat avec des industriels.
Ses implications seront essentiellement dédiées au développement des connaissances sur les voies de biosynthèse du métabolisme spécialisé des plantes comme les alcaloïdes, les terpènes, les lignanes ou les polyphénols: le candidat aura ainsi à assurer :
(i) la conception et le développement d’approches « omics » (transcriptomiques/génomiques)
(ii) leur analyse pour la prédiction de gènes candidats par analyse de corrélation d’expression/environnement génomique ou machine learning
(iii) de participer aux caractérisations des gènes candidats prédits via des approches de biologie moléculaire classiques et de génomique fonctionnelle (protéines recombinantes, tests enzymatiques, silencing/surexpression).
A ce titre, le/la candidate assurera un rôle de référent dans les projets de type transcriptomiques/génomiques menés par le laboratoire et assurera une interconnexion avec les autres membres de l’équipe pour le traitement des données issues de différents projets de recherche de l’équipe BBV. Son expertise sera également sollicitée pour optimiser la valorisation du métabolisme spécialisé à travers la bioproduction de molécules d’intérêt par ingénierie métabolique dans des microorganismes.
Le ou la candidate devra donc posséder une solide expertise en transcriptomique, génomique et en analyse bioinformatique. Des connaissances du métabolisme spécialisé des plantes tout comme des compétences reconnues en biologie moléculaire, biochimie, génomique fonctionnelle seront également demandées. Une expérience complémentaire en machine learning serait également appréciée.D’un point de vue de l’enseignement, le ou la Maître de conférences intégrera le Département de biologie et physiologie végétale et participera aux enseignements de biologie et physiologie végétales, des sciences omiques et de biotechnologie végétale de licence et master,