Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

scRNAseq recherche cancer myélome multiple Immunologie Analyse de données

Description

Contexte

L’équipe GENIM (Oncogénomique et Immunologie du Myélome), co-dirigée par Jill Corre et Ludovic Martinet, est basée au centre de recherche de cancérologie de Toulouse CRCT.
Nos travaux portent sur l’étude des profils génomiques et épigéntiques du compartiment immunitaire du myélome multiple.
Le/la candidat·e travaillera dans l’axe “immunologie du myélome”, en collaboration avec chercheurs et doctorants, principalement sur des projets murins.
Le but principal de ce projet de recherche serait donc de caractériser le micro-environnement tumoral via des approches bioinformatiques (principalement analyses de données scRNASeq).

Missions

• Analyse de données scRNAseq
• Demultiplexage et alignement de données
• Participation à la gestion du biobanking

Profil Recherché

Bac+5/master en bioinformatique ou équivalent
- Maîtrise de langages de programmation : R (principalement des packages bioconductor et Seurat), Python.
- Enironnement UNIX (bash)
- Connaissances en analyse de données scRNAseq
- Connaissances en immunologie
- Utilisation d’un cluster de calcul (Genotoul, HPC)
- Anglais écrit a minima
- Aprécié : Git, connaissances en statistiques
Compétences humaines :
- Rigueur, autonomie
- Bonne communication et esprit d’équipe
- Capacité à respecter les délais et ponctualité