2016-07-07 Bilan 2015-16

Compétences/technologies


7 juillet 2016

14h00 en salle 1-124 du bâtiment 5 du LIRMM

* Bilan
- 30/09: Session Dev-Stage-Prod Environment Guidelines
- 10/11: Session Cytoscape
- 27/11: Session Cloud IFB
- 17/02: Session Git
- 10/03: Session Snakemake
- 21/04: Session Ipython Jupyter
- 24/05: Session Drupal & design web
- 07/07: Bilan

* Groupes de travail
- Cytoscape: une session organisée en novembre
- R: abouti à un module diffusé sur bioconductor
- Ensembl et Galaxy: pas assez de participants

* Suggestions
- Réaliser une matrice des compétences de chaque membre afin de faciliter les interactions. Utilisation d'un code couleur pour indiquer "je suis un expert" ou "je recherche un expert"
- Développer la mise en pratique sous la forme de petit TP lors des sessions (quand la thématique s'y prête)

* Thématiques
- Shiny
- Web services: Oana pour UniProt, Emmanuelle pour DBsnips. Faire un inventaire des utilisateurs au sein de MBI
- Virtualisation
- Review des logiciels d'alignement (local, global): Blast, Fasta, Clustal, MAFFT,... Voir review de C. Notredame (Brief Bioinform. 2015)
- Variant calling