Bioinformatique et biostatistique, analyses de données de séquençage à haut débit.

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat renouvelable
Détails de renouvellement
CDD pouvant se transformer rapidement en CDI par accord mutuel.
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

1, place de l’hôpital
67000 Strasbourg
France

Contacts
Prof. Seiamak BAHRAM
Dr. Raphael CARAPITO
Email du/des contacts
seiamak.bahram@chru-strasbourg.fr
carapito@unistra.fr
Description

Ingénieur de recherche en biostatistique et bioinformatique

Hôpitaux Universitaires de Strasbourg / Laboratoire d’Immunologie

CADRE GÉNÉRAL
Dans le cadre d’un dialogue clinico-biologique intense, le poste suivant est immédiatement disponible.

MISSIONS
L'ingénieur(e) sera en charge de l'analyse biostatistique ainsi que de la mise en place d’outils d’analyses de données de séquençage à haut débit. Il (elle) devra pouvoir répondre aux différents besoins biostatistiques du service. Il (elle) saura utiliser et mettre en place des méthodes d’analyses innovantes nécessaires à l’analyse de données « omics ». Il (elle) sera confronté(e) à une grande variété de techniques de séquençage, à des approches biostatistiques/bioinformatiques nouvelles et à des ressources informatiques importantes.

ACITIVITES
-Activités principales :
*Analyses biostatistiques de données génomiques complexes
*Concevoir des modèles d'analyse et de nouveaux algorithmes
*Développer et améliorer des outils logiciels et des systèmes d'information dédiés
*Définir et choisir, en concertation avec ses interlocuteurs, la stratégie et les méthodes
d'analyses à mettre en œuvre
*Etre en échange constant avec le staff clinico-biologique du service.

-Activités associées :
* Présenter les résultats des analyses et participer à la diffusion des connaissances et des
outils biostatistiques
*Savoir conseiller et apporter des solutions d’analyses au besoin du service

COMPETENCES
*Savoir sur l’environnement professionnel :
• Bonnes connaissances des technologies de séquençage à haut-débit
• Bonnes connaissances d’un système distribué sous linux
• Savoir travailler en interaction avec plusieurs équipes de biologistes

*Savoir-faire opérationnel :
• Langages de programmation JAVA, PYTHON, PERL, R, Bioconductor, SQL, HTML, PHP
• Système de gestion de base de données (PostgreSQL, MySQL, Oracle, ...)
• Méthodes et analyses statistiques poussées
• Bonnes bases en biologie et en génétique, notamment en séquençage de nouvelle génération et en
génotypage
• Savoir gérer son activité et être force de proposition pour améliorer les performances et les résultats.
• Avoir une bonne maîtrise de l’anglais écrit et parlé.
• Une très grande motivation.

*Savoir-être :
Autonomie, posséder de réelles qualités de communication, le goût du travail en équipe, la rigueur et le sens de l’organisation.

*Nature de poste et salaire:
- Salaire en rapport avec compétences et expériences antérieures.
- CDD pouvant se transformer rapidement en CDI par accord mutuel.

*Coordonnées de la personne à contacter pour tous renseignements complémentaires :
Professeur Seiamak BAHRAM, Laboratoire d’Immunologie, NHC, 1 place de l’hôpital, 67091 Strasbourg Cedex. Téléphone : 03 69 55 08 04 mail : seiamak.bahram@chru-strasbourg.fr

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente