Ingénieur Bioinformaticien

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

19, rue Claude Bernard
75005 Paris
France

Contacts
Pierre de la Grange
Email du/des contacts
pierre.delagrange@genosplice.com
Description

GenoSplice est une société de services en bioinformatique. Depuis plus de 10 ans, les bioinformaticiens de GenoSplice accompagnent les équipes de recherche du monde entier. L’activité principale de la société est l’analyse des données de NGS à l’aide d’outils publiques et/ou développés en internes ou en partenariat.

GenoSplice recherche un nouvel ingénieur bioinformaticien. Le candidat sera notamment en charge de l’analyse de données NGS, ainsi que de développements et d’améliorations de pipelines. Il pourra également être amené à réaliser des études bibliographiques afin d’aider les clients de GenoSplice à interpréter leurs résultats.

Compétences requises :
- Connaissance de l’environnement d’exploitation Linux ;
- Maitrise de R, d’un ou plusieurs autre(s) langage(s) de programmation (bash, perl, python) et d’un système de gestion de base de données relationnelle (ex : MySQL) ;
- Connaissance des bases en génomique et de quelques outils dédiés à la visualisation des données de NGS (IGV…) ;
- Maîtrise de l'anglais pour l'interaction avec les partenaires non francophones et la rédaction de documentations/rapports d’analyse ;
- Aptitude à travailler en équipe et à interagir avec plusieurs interlocuteurs
- Rigueur et sens de l’organisation.

Compétences appréciées :
- Pratique du calcul distribué sur cluster ;
- Connaissance des outils d’analyses NGS : Alignement, comptage, annotations, contrôles qualité, outils statistiques (ex : DESeq2, edgeR)… ;
- Connaissance des analyses fonctionnelles par enrichissement, approches modulaires et analyses de réseaux de gènes ;
- Maitrise de PHP et de JAVA

Le candidat travaillera sur un environnement Linux, principalement au sein GenoSplice (Paris) mais pourra être amené à se déplacer fréquemment en Ile-de-France (chez des clients et/ou des collaborateurs de GenoSplice).

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente