Computational Biologist / Bio-informaticien, Bio-informaticienne

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

1 Rue Camille Desmoulins
92130 Issy-les-Moulineaux
France

Contacts
Tahera KAN, Senior Director Global Corporate Development - tkan@its.jnj.com
Guna Rajagopal, VP Responsable mondial, Sciences informatiques, Discovery Sciences R&D
Email du/des contacts
tkan@its.jnj.com
Description

VERSIONS EN FRANCAIS ET ANGLAIS CI-DESSOUS

ENGLISH VERSION
Computational Biologist (Principal Scientist), Location - France

Background
At the Janssen Pharmaceutical Companies of Johnson & Johnson, what matters most is helping people live full and healthy lives. We focus on treating, curing and preventing some of the most devastating and complex diseases of our time. And we pursue the most promising science, wherever it might be found. Janssen R&D (JRD) is an organization of 11,000+ people with an operating budget of $7B, which includes both Therapeutic Areas such as Cardiovascular/Metabolism, Immunology, Infectious Diseases/Vaccines, Neuroscience, Oncology and Pulmonary Hypertension, and major Global Functions in Discovery, Development and Regulatory Affairs.
We are Janssen. Our mission drives us. Our patients inspire us. We collaborate with the world for the health of everyone in it.
Thriving on a diverse company culture, celebrating the uniqueness of our employees and committed to inclusion, J&J is proud to be an equal opportunity employer.
Job Overview
We are looking for a Computational Biologist who will support our research and development collaborations and partnerships with public and private institutions in France. The ideal candidate is adept at using large data sets, to gain insights on the causes of disease and help identify drug targets and biomarkers that will enable the development of safe and effective therapies. He/She will address problems using computational models combined with AI/machine Learning tools to analyze a wide spectrum of biomedical data ranging from genomics to imaging in collaboration with our scientific collaborators within and outside of Janssen R&D and help in the translation of the knowledge gained into therapies. The ideal candidate must have strong experience using a variety of data mining/data analysis methods, using a variety of data tools, building and implementing models, using/creating algorithms and creating/running simulations. Expertise in deploying AI/ML tools and techniques within the biomedical context would be a plus. They must have a proven ability to drive scientific results with their data-based insights. They must be comfortable working with a wide range of stakeholders and functional teams in academia and industry, within and outside of France. The right candidate will have a passion for discovering solutions hidden in large data sets and working with stakeholders to improve scientific, therapeutic and business outcomes.

Responsibilities include:
 Work with stakeholders throughout the organization to identify opportunities for leveraging company data to drive scientific/business solutions.
 Aggregate, Integrate, Mine and Analyze data from company & partner databases to drive optimization and improvement of therapeutic development, scientific and business strategies in line with Janssen R&D goals and objectives.
 Assess the effectiveness and accuracy of new biomedical data sources and data gathering techniques especially in the genomics and healthcare environment.
 Develop custom data models and algorithms to apply to data sets to address specific questions/hypothesis related to drug discovery or use of real-world evidence for healthcare solutions.
 Use predictive modeling to increase and optimize end user experiences in collaborative projects
 Coordinate with different functional teams to interpret and implement results of studies and monitor outcomes
 He/she will perform research relevant to the mission of the organization and publish high quality research.
 He/She will act as key technical resource for researchers seeking assistance with development and implementation of computational, mathematical, statistical and visualization techniques to extract knowledge form their data
 He/she will design and implement approaches to solve complex computational and mathematical problems as they relate to interpreting biomedical data.

Qualifications for this position:
 Excellent written and verbal communication skills for presenting findings and coordinating across teams in French and English is a key requirement.
 Strong problem-solving skills with an emphasis on addressing problems in drug discovery and healthcare.
 Experience and expertise in deploying computational biology, AI/ML tools and techniques to biomedical data generated from large-scale population genomics, medical imaging or multi-omics research/clinical studies
 Experience using statistical computer languages (R, Python, SLQ, etc.) to manipulate data and draw insights from large data sets.
 Knowledge of a variety of machine learning techniques (clustering, decision tree learning, artificial neural networks, etc.) and their real-world advantages/drawbacks.
 Knowledge of advanced statistical techniques and concepts (regression, properties of distributions, statistical tests and proper usage, etc.) and experience with applications.
 Outstanding communication, organizational and leadership skills, with a successful track record of collaborating with cross-functional scientific teams
 Independent, self-motivated and innovative. Ability to excel in a goal-oriented, multifaceted and fast-moving team environment. A track record of strong management skills and demonstrated ability to lead a group of scientists to deliver on objectives in defined timelines would be a plus.
 A drive to learn and master new technologies and techniques.

We’re looking for someone with 3-5 years of experience manipulating data sets and building statistical models, has a PHD in Computational/systems Biology, Bioinformatics, Statistical/Population Genetics, Biostatistics/Statistics, Mathematics, Computer Science or another quantitative field, and is familiar with the following software/tools:
 Coding knowledge and experience with several languages: R, Python, C, C++, Java, JavaScript, etc.
 Knowledge and experience in statistical and data mining techniques: GLM/Regression, Random Forest, Boosting, Trees, text mining, social network analysis, etc.
 Experience querying databases and using statistical computer languages: R, Python, SLQ, etc.
 Experience using web services: Redshift, S3, Spark, DigitalOcean, etc.
 Experience with high performance/cluster computing, distributed data/computing tools: Map/Reduce, Hadoop, Hive, Spark, etc. is a plus
 Experience visualizing/presenting data for stakeholders using: Periscope, Tableau, ggplot, etc.

Application Procedure
All applicants will need to submit the following materials in PDF format.
• Curriculum vitae
• Research and/or work accomplishments, (maximum of 4 pages)
• Contact information (Phone/email/Skype) for at least three references. Each referee will be asked to submit a letter of reference for applicants within two weeks of the submission of your application. Please encourage your referees to comply with this timetable.
Point of contact: Dr. Guna Rajagopal, VP – Global head, Computational Sciences, Discovery Sciences, Janssen Pharmaceutical R&D (a J&J company)
Contact : Tahera KAN, e-mail : tkan@its.jnj.com

VERSION FRANCAISE
Bio-informaticien / Bio-informaticienne (Scientifique principal), Site - France

Qui sommes-nous ?
Chez Janssen, Sociétés pharmaceutiques de Johnson & Johnson, le plus important est d’aider les gens à vivre leur vie pleinement et sainement. Nous œuvrons au traitement, à la guérison et à la prévention de certaines des maladies les plus dévastatrices et complexes de notre époque. En outre, nous poursuivons la science la plus prometteuse, où qu’elle se trouve. Janssen R&D (JRD) est une organisation de plus de 11 000 personnes avec un budget de fonctionnement de 7 milliards de dollars, qui comprend à la fois des domaines thérapeutiques tels que les Maladies cardiovasculaires et du métabolisme, l’Immunologie, les Maladies infectieuses et vaccins, les Neurosciences, l’Oncologie and l’Hypertension pulmonaire, ainsi que des fonctions mondiales majeures dans les domaines de la Découverte, du Développement et des Affaires réglementaires.
Nous sommes Janssen. Notre mission nous anime. Nos patients nous inspirent. Nous collaborons avec le monde pour la santé de chacun.
Parce que nous prospérons en phase avec une culture d’entreprise diversifiée, célébrons la singularité de nos employés et nous engageons en faveur de l’inclusion, Johnson & Johnson est une entreprise fière d’être un employeur respectueux de l’égalité des chances.

Présentation du poste
Nous recherchons un bio-informaticien / une bio-informaticienne qui soutiendra nos collaborations et partenariats de recherche et développement avec des institutions publiques et privées en France. Le candidat idéal est capable d’utiliser de grands ensembles de données pour obtenir des informations sur les causes des maladies et aider à identifier les cibles médicamenteuses et les biomarqueurs qui permettront le développement de thérapies sûres et efficaces. Il / elle abordera les problèmes à l’aide de modèles informatiques combinés à des outils d’IA / apprentissage machine pour analyser un large éventail de données biomédicales allant de la génomique à l’imagerie, en collaboration avec nos collaborateurs scientifiques au sein et en dehors de Janssen R&D, et aidera à traduire les connaissances acquises en thérapies. Le candidat idéal devra avoir une solide expérience en termes d’utilisation de diverses méthodes d’exploration / analyse de données, d’utilisation de divers outils de données, de construction et de mise en œuvre de modèles, d’utilisation / création d’algorithmes, ainsi que de création / exécution de simulations. Une expertise dans le déploiement d’outils et de techniques IA / AM dans le contexte biomédical serait un plus. Le candidat devra faire preuve d’une capacité avérée à produire des résultats scientifiques par le biais de ses connaissances basées sur les données. Il devra être à l’aise avec un large éventail d’acteurs et d’équipes fonctionnelles dans le monde académique et industriel, en France et à l’étranger. Enfin, le candidat sera animé par la passion de découvrir des solutions cachées dans de grands ensembles de données et de collaborer avec les parties prenantes pour améliorer les résultats scientifiques, thérapeutiques et commerciaux.

Responsabilités :
 Collaborer avec des acteurs issus de l’ensemble de l’organisation pour identifier les opportunités d’exploitation des données de l’entreprise dans le but de développer des solutions scientifiques / commerciales.
 Agréger, intégrer, exploiter et analyser les données issues des bases de données de l’entreprise et de ses partenaires afin de favoriser l’optimisation et l’amélioration du développement thérapeutique, ainsi que des stratégies scientifiques et commerciales, conformément aux objectifs R&D de Janssen.
 Évaluer l’efficacité et l’exactitude de nouvelles sources de données biomédicales et de techniques de collecte de données, en particulier dans les domaines de la génomique et du médical.
 Développer des modèles de données et algorithmes personnalisés à appliquer aux ensembles de données pour répondre à des questions / hypothèses spécifiques liées à la découverte de médicaments ou à l’utilisation de preuves concrètes servant à des solutions de santé.
 Utiliser la modélisation prédictive pour augmenter et optimiser les expériences des utilisateurs finaux dans des projets collaboratifs.
 Se coordonner avec différentes équipes fonctionnelles pour interpréter et mettre en œuvre les résultats des études et en surveiller l’aboutissement.
 Effectuer des recherches pertinentes pour la mission de l’organisation et publier des recherches de qualité supérieure.
 Constituer une ressource technique clé pour les chercheurs qui ont besoin d’aide dans le développement et la mise en œuvre de techniques de informatiques, mathématiques, statistiques et de visualisation pour extraire les connaissances de leurs données.
 Concevoir et mettre en œuvre des approches pour résoudre des problèmes informatiques et mathématiques complexes liés à l’interprétation de données biomédicales.

Qualifications requises pour ce poste :
 Excellentes compétences en communication écrite et orale, essentielles pour présenter les résultats et coordonner les équipes en français et en anglais.
 Solides compétences en résolution de problèmes, avec un accent mis sur la résolution de problèmes liés à la découverte de médicaments et à la santé.
 Expérience et expertise dans l’application de la bio-informatique et des outils et techniques IA / AM aux données biomédicales générées par la génomique des populations à grande échelle, l’imagerie médicale ou la recherche / les études cliniques multi-omiques.
 Expérience dans l’utilisation de langages de programmation (R, Python, SQL, etc.) pour manipuler les données et tirer des enseignements de grands ensembles de données.
 Connaissance de diverses techniques d’apprentissage machine (partitionnement, apprentissage par arbre de décision, réseaux de neurones artificiels, etc.) et de leurs avantages / inconvénients dans le monde réel.
 Connaissance de techniques et concepts statistiques avancés (régression, propriétés des distributions, tests statistiques et bon usage, etc.) et expérience des applications.
 Excellentes compétences en matière de communication, d’organisation et de leadership, avec une expérience réussie en termes de collaboration avec des équipes scientifiques pluridisciplinaires
 Autonomie, motivation et innovation. Capacité à exceller dans un environnement d’équipe orienté vers les objectifs, caractérisé par de multiples facettes et qui évolue rapidement. Une solide expérience en gestion et une capacité démontrée à diriger un groupe de scientifiques pour atteindre les objectifs dans des délais définis seraient un plus.
 Désir d’apprendre et de maîtriser les nouvelles technologies et techniques.

Nous recherchons une personne possédant 3 à 5 ans d’expérience dans la manipulation d’ensembles de données et la construction de modèles statistiques, titulaire d’un doctorat en Biologie informatique / des systèmes, en Bio-informatique, en Génétique statistique / des populations, en Biostatistique / Statistiques, en Mathématiques, en Informatique ou tout autre domaine quantitatif, et qui soit familiarisée avec les logiciels / outils suivants :
 Connaissances et expérience du codage dans plusieurs langages : R, Python, C, C++, Java, JavaScript, etc.
 Connaissances et expérience des techniques statistiques et d’exploration de données : MLG / régression, forêt d’arbres décisionnels, boosting, arbres décisionnels, extraction de connaissances, analyse des réseaux sociaux, etc.
 Expérience de l’interrogation de bases de données et de l’utilisation de langages de programmation : R, Python, SQL, etc.
 Expérience dans l’utilisation de services web : Redshift, S3, Spark, DigitalOcean, etc.
 Expérience du calcul intensif / en grappes, des données distribuées / des outils informatiques suivants : MapReduce, Hadoop, Hive, Spark, etc. serait un plus.
 Expérience dans le domaine de la visualisation / présentation de données aux parties prenantes, à l’aide de : Periscope, Tableau, ggplot, etc.

Procédure de candidature
Tous les candidats devront transmettre les documents suivants au format PDF :
• Curriculum vitæ
• Réalisations en matière de recherche et/ou de travail (4 pages maximum)
• Coordonnées (téléphone / e-mail / Skype) pour trois recommandations minimum. Chaque référent devra remettre une lettre de référence aux candidats dans les deux semaines suivant le dépôt de la candidature. Veuillez encourager vos référents à respecter ce délai.

Interlocuteur : Dr. Guna Rajagopal, VP – Responsable mondial, Sciences informatiques, Discovery Sciences R&D Janssen Pharmaceutical (une société de Johnson & Johnson)

Contact : Tahera KAN, e-mail : tkan@its.jnj.com

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente