Master Alternance : Evaluation, développement et mise en place de pipelines/portails/méthodes

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

114 RUE EDOUARD VAILLANT
94800 VILLEJUIF
France

Contacts
Marc DELOGER
Email du/des contacts
marc.deloger@gustaveroussy.fr
Description

Contexte scientifique spécifique : Premier centre européen de lutte contre le cancer, Gustave Roussy est un centre de soins, de recherche et d'enseignement, qui prend en charge des patients atteints de tout type de cancer. La plateforme de bioinformatique de Gustave Roussy a été créée pour répondre aux besoins de ses équipes de recherches. Elle propose différents services, allant de l’analyse de données de génomique au montage de projets en bioinformatique. Elle participe à l’évaluation, au développement et à la mise en place de pipelines d’analyse et des outils d’aide à l’interprétation (portails) des données de séquençage.

Mission(s) de l’apprenti dans ce contexte : Le candidat pourra, en fonction de ses compétences et de ses appétences, participer à des missions variées, dans les différents domaines suivants :

- Analyse comparative d'outils, optimisation des paramètres et validation des résultats avec les biologistes/cliniciens

- Développement de pipelines (en suivant des règles de qualité/robustesse/portabilité/reproductibilité)

- Développement de portails web conviviaux d'aide à l'interprétation des résultats pour les biologistes/cliniciens

- Mise en place de portails web permettant d’explorer, visualiser et analyser des données de génomiques de type ADN, ARN, protéines, provenant de multiples études de médecine de précision (style cBioPortal)

- Mise en place de bases de "connaissance" de variants (pathogénicité, récurrence, faux-positifs etc...)

Donc si vous êtes curieux, que vous avez envie d'apprendre, que vous avez l'esprit d'équipe et que vous aimez le travail collaboratif, surtout n'hésitez plus et envoyez votre CV et lettre de motivation, vous ne le regretterez pas :-)

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente