Chef de Projet R&D Bioinformatique (H/F)

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

11 rue Watt
75013 Paris
France

Contacts
Dangles Christine
Email du/des contacts
office@pathoquest.com
Description

PathoQuest est une société de biotechnologie, spin off de l’institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le diagnostic des maladies infectieuses et la sécurisation des produits pharmaceutiques d’origine biologique. Notre business unit « Biologics Genomic Service » propose aux acteurs de l’industrie pharmaceutique un service expert en génomique, basé sur une plateforme de séquençage NGS (Next Generation Sequencing) et sur des pipelines d’analyses bioinformatiques de pointe. Les débits délivrés par les technologies NGS nous confrontent régulièrement à des problématiques type « Big Data » et de plus en plus d’acteurs de premier plan de l’Industrie des Biotechnologies et de la Pharma nous font confiance pour évaluer la sécurité virale et la stabilité génétique de leur produits biologiques innovants. Aujourd’hui en pleine expansion, nous renforçons notre pôle Recherche & Développement – Analyses Bioinformatiques – Caractérisation Génétique.

Vos Missions
Sous la responsabilité directe du Directeur du Département de Bioinformatique, votre savoir-faire vous permet de soutenir notre croissance et ouvrir de nouveaux marchés. Votre mission sera la conduite de projets R&D bioinformatique en lien notamment avec notre activité caractérisation génétique de produits (vecteurs) ou de systèmes de production cellulaires (banques cellulaires).

Vos responsabilités
• Participer aux activités de Recherche et Développements autour des pipelines d’analyses de la société : fouille des données, veille scientifique, benchmarks d’outils et de process, développements dédiés
• Évaluer / challenger la performance du pipeline de caractérisation génétique et mener à bien son développement, sa validation pour une opération en environnement BPL/BPF (Bonnes Pratiques de Laboratoire/Fabrication), son maintien et son optimisation (banques, workflow d’analyses, documentation, benchmarks)
• Analyser les données de séquençage et les rapports fournis par les pipelines de la société, faire remonter les principaux résultats et points d’amélioration
• Tester et comparer de nouveaux outils de la communauté en vue de l’optimisation des pipelines d’analyses de la société
• Participer à l’assurance qualité des produits selon le référentiel des Bonnes Pratiques de Laboratoire/Fabrication (BPL/BPF)

Description du profil
• L’innovation vous passionne, le défi vous motive
• Forte attirance pour le travail en équipe
• Master 2 Bioinformatique avec 3 ans d’expérience minimum ou d’un doctorat en Bioinformatique
• Scripting/Programmation (Shell, R, python)
• Expérience dans l’analyse de données NGS
• Bonne connaissance des algorithmes et outils de détection de variants génétiques (SNPs, SNVs…)
• Une connaissance des algorithmes et outils d’assemblage de génomes/transcriptomes est un plus
• Niveau basique en statistiques (statistiques descriptives, tests d’hypothèses)
• Anglais courant (oral, écrit)

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente